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新疆是我国盐湖资源集中的地区之一,新疆属于干旱区,日照强度和蒸发量高以及盐的类型多样,这类独特的盐湖中蕴藏着各种不同于其它湖泊的微生物资源和产酶微生物资源。本研究以新疆地区的几个盐湖为研究对象,将未培养和可培养的方法进行嗜盐古菌多样性分析以及对分离得到的嗜盐古菌中筛选出产胞外蛋白酶、脂酶、淀粉酶和明胶水解酶等产酶菌株,丰富我国嗜盐古菌资源和产酶菌株资源。本文以新疆地区的巴里坤湖（BLK）p H为8.53、盐度为1.54;吐鲁番盐水坑（TYK）p H为8.11,盐度为2.94;吐鲁番火焰山神泉（SQ）p H为8.21,盐度为0.76;艾比湖（AB）p H为9.06、盐度为1.90;达坂城盐湖（DBC）p H为7.32、盐度为2.46等不同盐湖样品为研究对象,利用未培养技术进行嗜盐古菌多样性分析。研究结果显示巴里坤湖样品获得的OTU数量为131,优势门是Euryarchaeota门,占总微生物数量的40%;达坂城盐湖,OTU数量为84,优势门是Euryarchaeota门,占总微生物数量的65%;吐鲁番火焰山神泉获得的总OTU数量为17,在门水平上优势类群是Cloacimonetes,占总微生物数量的24%;吐鲁番盐矿盐水坑总获得OTU数量为69,优势类群为Proteobacteria门,占嗜盐微生物门水平总数量的31%;艾比湖获得的总OTU数量为5,占优势的门为Euryarchaeota,占总量的68%。根据Alpha多样性指数变化,显示在艾比湖样品的群落丰富度最低,其次为吐鲁番火焰山神泉样品,在达坂城盐湖样品的群落多样性最高。从六个盐湖样品中（增加艾丁湖和玛纳斯湖样品,由于高通量测序结果显示吐鲁番神泉样品中的嗜盐古菌极少因此去除吐鲁番神泉样品）利用可培养的方法共分离出570株嗜盐古菌,其中艾丁湖样品中分离到20株嗜盐古菌,分11个属的12个分类单元;艾比湖样品中分离到197株嗜盐古菌,分21个属的36个分类单元;玛纳斯湖样品中分离到172株嗜盐古菌,分7个属的14个分类单元;达坂城盐湖样品中分离到42株嗜盐古菌,分4个属的7个分类单元;巴里坤湖样品中分离到19株嗜盐古菌,分5个属的5个分类单元;吐鲁番盐水坑样品中分离到120株嗜盐古菌,分10个属的23个分类单元,通过计算和比较Shannon多样性指数得知六个地区的样品中嗜盐古菌Shannon多样性高到低的循序分别为艾比湖3.102、吐鲁番盐水坑2.485、艾丁湖2.181玛纳斯湖1.870、达坂城盐湖1.515、巴里坤湖1.133;而Berger-Parker优势度指数高到低的循序是巴里坤湖0.550、玛纳斯湖0.424、达坂城盐湖0.405、艾丁湖0.300、吐鲁番盐水坑0.242、艾比湖0.137,艾丁湖和玛纳斯湖样品中分离的嗜盐古菌中没有发现特有类群;艾比湖样品中分离的嗜盐古菌中Halarchaeobius、Halovenus、Halovivax、Natrinema为特有属;达坂城盐湖样品中分离的嗜盐古菌中Halorubellus、Natronoarchaeum为特有属;巴里坤湖样品中分离的嗜盐古菌中Halohasta为特有属;吐鲁番盐水坑样品中分离的嗜盐古菌中Halobiforma、Halopiger为特有属,而六个样品中共有类群为Halorubrum属。从分离得到的570株嗜盐古菌中通过平板筛选法获得33株具有产胞外酶能力的菌株;其中产蛋白酶的菌株有12株,产酶能力最好的菌所产生的透明圈直径比达到3.75;产脂酶的菌株有1株,透明圈直径比达到3.89;产明胶水解酶的菌株有12株,最大的透明圈直径比达到5.83;产淀粉酶的菌株有21株,最大的透明圈直径比达到9.2;33株嗜盐古菌中没有能同时产以上四种酶的菌株,但AD-16与TYK-17能产蛋白酶、淀粉酶和明胶水解酶,AB-54能产淀粉酶、明胶水解酶和脂酶;MNS-39与TYK-26能产蛋白酶和明胶水解酶,AB-154与AD9-12能产明胶水解酶和淀粉酶,AB-17与MNS-5能产淀粉酶和蛋白酶。嗜盐古菌来源的胞外酶在高盐工业生产中具有良好的应用潜在价值。