EMT转录因子Twist1在肝癌血管生成拟太形成中差异microRNA的筛选

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jianjia88521
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的:   miRNA(microRNA)是一些长度很短的非编码RNA,通过降低靶基因的稳定性或抑制其翻译水平来影响细胞的分化、增殖和凋亡。最近有研究表明miRNA对于肿瘤形成起到重要作用。关于其在VM发生发展中所起的作用,已经日益成为研究的热点,本课题采用博奥公司miRNA基因芯片检测肝细胞肝癌HepG2过表达Twist1后差异表达的miRNA基因,并采用实时定量PCR验证芯片结果的准确性;通过生物信息学分析差异miRNA的作用靶点,筛选出VM相关miRNA,并探讨其在VM形成中发挥作用的可能机制。该研究结果为探明miRNA在Twist1调控EMT进而促进VM形成过程中发挥其调控作用的具体机制提供理论指导和实验依据。   方法:   本研究将人肝癌细胞株HepG2作为细胞研究对象,通过构建Twist1表达质粒并转染HepG2细胞获得过表达Twist1的肝癌细胞模型,以未转染的HepG2细胞作为对照,分别提取RNA,在此基础上利用博奥公司的miRNA芯片对其进行实验分析过表达Twist1可引发的miRNA表达谱变化,建立miRNA基因表达谱,找出明显上调或下调的基因进行分析。   从中选取表达差异最明显的上调的hsa-miR-128及下调的has-miR-27a、has-miR-26b、has-miR-17,采用实时定量PCR技术进一步验证芯片的结果,并用U6作为内参。芯片检测结果数据由上海其明公司结合生物信息学方法利用TargetScan数据库查询miRNA的靶基因,通过筛选已报道与VM相关的靶基因找出可能在VM形成过程中具有调控作用的miRNA。   结果:   1.在HepG2细胞过表达Twist1的肝癌细胞模型中查出差异表达有统计学意义的18个miRNA:其中上调的miRNA基因5个:has-miR-128、has-miR-132、has-miR-151-5p、has-miR-26a、has-miR-3195;下调的miRNA基因13个:has-miR-25、has-miR-1246、has-miR-19a、has-miR-378、has-miR-486-3p、has-miR-140-3p、has-miR-26b、has-miR-27a、has-miR-19b、has-miR-1260b、has-miR-23b、has-miR-17、has-miR-9。   2.miRNA的实时定量PCR验证结果显示:has-miR-27a、has-miR-26b、has-miR-17在 HepG2-Twist1细胞中相对低表达,而has-miR-128在HepG2-Twist1细胞中相对高表达,与芯片结果基本吻合。   3.生物信息学预测到的靶基因情况:miRNA靶基因个数不尽相同,有数百种甚至上千种;在众多靶基因中筛选出与VM相关的VE-cadherin、EphA2、MMP2和VEGF-A等靶基因以及对应的miRNA(has-miR-27a、has-miR-26b和has-miR-17)。   结论:   1.HepG2细胞过表达Twist1后有18种miRNA发生明显的表达变化,其中包括5种上调表达:has-miR-128、has-miR-132、has-miR-151-5p、has-miR-26a、has-miR-3195;和13种下调表达:has-miR-25、has-miR-1246、has-miR-19a、has-miR-378、has-miR-486-3p、has-miR-140-3p、has-miR-26b、has-miR-27a、has-miR-19b、has-miR-1260b、has-miR-23b、has-miR-17、has-miR-9。   2.has-miR-27a、has-miR-26b和has-miR-17可能在VM形成过程中通过改变VE-cadherin、EphA2、MMP2和VEGF-A等转录因子的表达发挥潜在的抑制VM形成的作用。   3.Twist1促使肿瘤细胞发生EMT后,肿瘤细胞has-miR-27a、has-miR-26b和has-miR-17的表达发生改变,进而调控靶基因VE-cadherin、EphA2、MMP2和VEGF-A的表达,最终影响了VM的形成。
其他文献
在创意园区发展过程中,不必过于害怕,处在大发展的过程中,问题总会有的。可以在发展中解决,在发展中调整。《中国广告》:从经济发展层面,你如何看待广告产业园区的重要性?叶
我国对三十烷醇的喷施浓度、适时、时间、方法和三十烷醇质量、剂型、药液 pH 值、金属离子浓度等方面的研究获得了结果。但对其增产效果的研究,由于众多研究者所采用的试验
随着我国国民经济的快速发展,水利水电工程建设作为我国国民经济发展的基础产业也取得了长足发展,但与此同时,水利水电工程市场竞争机制也愈发激烈,企业的生存空间越来越狭窄
面对来势汹汹的超高清蓝光以及各种具备了HDR技术的4K流媒体,各大平板电视厂商都开始把精力投放在HDR与WCG之上,其中绝大部分的国内外厂商都表示将会在未来几年之中,让更多的
黄冈晒烟有悠久的种植历史。据黄冈县志史料记栽,始种于明末清初(公元1620——1643年),距今3百余年。黄冈晒烟在清同治十二年间最高产量达7.2万余担(年产4800包,每包净重75
通过对柔性机械臂动力学系统的零极点及其模态参量渐近行为的解析分析 ,讨论了模态截取和零点截取有限维近似模型动力学奇异性关于阶次的渐近行为 ,并进行了比较研究 .此外 ,
曲曲平原霜气凉,疏林秋老栗拳张。山鼷跳踯真堪喜,天籁情趣绕梓桑“。松鼠嗜食松果胡桃,性灵活泼好动的形象,向为画家笔下描绘的性灵之物。宋代赵昌、元代钱选、明代朱瞻基都
种子活力受基因控制,受生态条件和生产条件的制约,而种子生产的技术措施对种子活力有着显著的影响。一、播种期对种子活力的影响 1983年将春小麦阿勃、晋2148、高原338三个
(一)前言根据中日两国政府的协议,由中国云南省农业科学院和日本热带农业研究中心进行“利用有关遗传资源培育耐寒、抗病、高产水稻品种的共同研究”。云南与日本因地理环境
以间甲基苯甲酸和二甘醇为原料,钛酸四丁酯为催化剂合成了二乙二醇二间甲基苯甲酸酯.考查了催化剂及其用量、反应温度、原料配比等条件对反应的影响,经过试验确定适宜工艺条