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3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶（HMGCR）是胆固醇生物合成过程中的限速酶，并且在内源胆固醇生物合成途径中扮演着重要的角色。本研究中，我们以HMGCR基因为候选基因，使用DNA池测序技术、PCR扩增技术、PCR-RFLP技术和CRS-PCR-RFLP技术在固始鸡-安卡鸡F2代资源群及丝毛乌骨鸡中检测遗传变异情况，并分析了该基因的突变位点与固始鸡-安卡鸡F2代资源群主要经济性状和丝毛乌骨鸡蛋品质及鸡蛋胆固醇含量之间的关联性。主要结果如下：1、在固始鸡-安卡鸡F2代资源群中，在鸡3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因上检测到51个SNPs，具体分析了其中的3个。其中A5816T位点位于内含子8内；G12217T位点处于外显子17上，导致了谷氨酸→组氨酸的错义突变；T12684C位点位于外显子18上，其引起了脯氨酸的同义突变。通过PCR-RFLP或CRS-PCR-RFLP法，对A5816T、G12217T和T12684C进行分析。群体遗传学表明：A5816T、G12217T和T12684C突变位点多态信息含量均为中度多态位点；这三个位点的杂合度分别为0.4915、0.4546、0.4774。2、对3个酶切位点多态性与固始鸡-安卡鸡资源群F2代群体主要经济性状关联分析表明，HMGCR基因A5816T位点两种基因型与出生重、12周龄体重、12周龄胸骨长、8周龄胸深、腿肌剪切力、胸肌剪切力、腿肌纤维直径、碱性磷酸酶、低密度脂蛋白和乳酸脱氢酶显著相关（P<0.1）；G12217T位点对屠体重、半净膛重、全净膛重、头重、爪重、心脏重、脾脏重、腿重、腿肌重、爪率、双翅率、2,4,6,8,10,12周龄体重、12周龄胫长、12周龄胫围，8,12周龄盆骨宽、4,8,12周龄体斜长、4,8,12周龄胸骨长、腿肌纤维密度、腿肌纤维直径、胸肌纤维圆度、胸肌纤维直径、碱性磷酸酶、乳酸脱氢酶、总蛋白和低密度脂蛋白具有显著影响（P<0.1）；T12684C位点不同基因型对半净膛重、心脏重、腿肌重、胰腺率、2,4,6,8,12周龄体重、8周龄胫长、4,8,12周龄胫围、4,12周龄体斜长、12周龄胸骨长、腹脂率、腿肌纤维密度、谷草转氨酶、总蛋白、白蛋白、球蛋白、胆碱酯酶、甘油三酯、乳酸脱氢酶具有显著影响（P<0.1）。3、在丝毛乌骨鸡中验证鸡3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因G12217T和T12684C两个突变位点，群体遗传学表明：G12217T和T12684C突变位点多态信息含量均为中度多态位点；这三个位点的杂合度分别为0.499、0.504。4、对2个突变位点多态性与丝毛乌骨鸡蛋品质及鸡蛋胆固醇含量的关联性进行分析表明，G12217T突变位点仅对鸡蛋中胆固醇含量具有显著的影响（P<0.1）；T12684C突变位点三种基因型与蛋黄重显著相关（P<0.1）。