水稻白叶枯病是一种危害性严重的细菌性病害,在世界主要稻作区都有发生。发掘和利用水稻白叶枯抗病基因,培育抗病品种是防治该病最经济有效的方法。在前期研究中,我们从来源于黄华占/PSBRC的BC1F4导入系中发掘一个水稻白叶枯病抗性新基因,将其命名为Xa39。该基因抗性水平高、抗谱广,在水稻育种中具有重要的应用价值。本研究以FF329为供体亲本和HHZ为轮回亲本杂交构建F2定位群体,采用SSR分子标记精细定位Xa39基因,利用4个育种群体对Xa39两个紧密连锁的分子标记RM26985和RM206进行了有效性评价,并且将该分子标记利用MAS育种改良了水稻白叶枯抗性。主要结果如下:1.利用分离集团分析法(BSA),对516对SSR分子标记、46对Indel分子标记以及自行设计的30对分子标记筛选,根据获得的与Xa39基因连锁分子标记,构建了Xa39基因的分子标记连锁图谱,将该基因定位在水稻第11染色体上,分子标记RM26985和DM13之间,并该区间97.4 kb范围内预测到10个候选基因。2.利用与Xa39基因紧密连锁的分子标记RM26985和RM206,检测了4个育种4FL10、4FL14、4FL21和4FL25群体,结合接种鉴定,检验分子标记用于辅助选择(MAS)的效率。结果分子标记RM26985和RM206的MAS准确率分别达到95.81%和93.61%,同时使用准确率达到95.59%,上述两个标记在水稻白叶枯病抗性改良育种中可以提高Xa39的选择效率。3.通过杂交和回交的手段将抗病基因转育到感病亲本BT4、BT18的遗传背景下,已获得优良抗病株系BC3F2。