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目的：研究原发性肝细胞癌中FOXC2和FOXE1mRNA及蛋白的表达水平,探讨FOXC2/FOXE1与各临床病理指标的关系。方法：收集23例原发性肝细胞癌组织、配对癌旁组织以及5例正常肝组织,采用实时荧光定量PCR检测FOXC2和FOXE1的mRNA表达水平,采用Western-blot检测FOXC2和FOXE1的蛋白表达水平,采用免疫组化检测FOXC2和FOXE1的定位,并分析FOXC2和FOXE1表达水平和临床病理指标的关系。结果：1.FOXC2mRNA表达在肝癌组织表达明显高于癌旁组织及正常组织(2.4650±0.9604vs1.1625±0.9317vs1.0244±0.9246, P<0.05)。FOXE1mRNA表达在肝癌组织表达明显低于癌旁组织及正常组织(0.3881±0.1104vs0.7514±0.1567vsl.1794±0.1627, P<0.05)。2. FOXC2蛋白表达在肝癌组织表达明显高于癌旁组织及正常组织(0.6357±0.3155vs0.0614±0.3031vs0.3031±0.0432, P<0.05)FOXE1蛋白表达在肝癌组织表达明显低于癌旁组织及正常组织(0.2923±0.0503vs0.6710±0.0685vs0.7603±0.1116, P<0.05)3.FOXC2在肝癌组织中表达强阳性,在部分癌旁组织及正常肝组织中则阳性表达较微弱,阳性颗粒主要表达在细胞浆中,FOXE1在肝癌组织中表达较微弱,在部分癌旁组织及正常肝组织中则阳性表达较强烈,阳性颗粒主要表达在细胞核中。4.FOXC2的表达在高Edmondson分级组和高TNM分期组及血管侵犯组和包膜侵犯组中明显升高(P<0.05)。FOXE1的表达在同Edmondson分级组和高TNM分期组中及血管侵犯组和包膜侵犯组中明显降低(P<0.05),在无包膜组中,FOXE1表达明显降低(P<0.05)。结论：1.FOXC2mRNA及蛋白的表达在肝癌组织中明显升高,且在肝癌组织中FOXC2的表达在高Edmondson分级组和高TNM分期组及血管侵犯组和包膜侵犯组中明显升高。FOXC2可能参与了肝癌的发生发展过程。2.FOXE1mRNA及蛋白的表达水平在肝癌组织中明显降低,且在肝癌组织中FOXE1的表达在高Edmondson分级组和高TNM分期组中及血管侵犯组和包膜侵犯组中明显降低,在无包膜组中,FOXE1表达降低。FOXE1可能参与了肝癌的发生发展过程。