miR-445-3p调控肺癌细胞侵袭机制的研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jihuoxiazai
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
MiRNAs是内源性的、非编码、长度为20-25碱基的单链小分子RNA。通过5端种子区的2-8碱基,根据碱基配对原则,与mRNA的3UTR完全或不完全互补,以“一对多”或者“多对一”的方式,转录后调控数量不等mRNA的表达,最终抑制其蛋白质翻译,改变表型。miRNAs在诸多方面都发挥着重要的作用,参与细胞发育、应激反应、病毒感染、癌症、心脏病等,影响几乎所有的信号通路,是除转录因子以外,又一个起着重要的调控作用的大家族成员。   目前研究发现肿瘤中存在miRNAs表达失调,miRNAs以致癌基因或抑癌基因作用来调节其他原癌基因或抑癌基因的表达。高表达者抑制抑癌基因发挥促癌作用,例如MiR-21在肝癌中过表达,通过抑制抑癌基因PTEN发挥促癌作用;低表达的miRNAs抑制癌基因发挥抑癌作用,例如Let-7在肺癌中失表达,失去了对癌基因MYC的抑制作用而发挥抑癌作用。   本研究利用miRNA microarray对选取的6例非小细胞肺癌与癌旁组织miRNAs表达谱进行检测,筛选出一组差异性表达10倍以上的miRNAs。首先,根据已有比较基因组研究报道,miR-455-3p的基因组定位区域,是肺癌的遗传学变异区;其次,miR-455-3p可能调控的靶基因多为肿瘤相关基因,可能调控的靶基因ACVR2B、EI24、HDAC2、PIK3R1、SMAD2等参与了恶性肿瘤的演变过程,参与信号通路与肿瘤的关系密切;再者,miR-455-3p与靶基因调控位点的遗传保守性强。另外,在miR-455-3p可能调控的靶基因中Smad2在肺癌中缺失表达,与肿瘤的侵袭转移有关,并且基因水平突变率低,提示了Smad2的转录水平和蛋白水平调控的不一致现象。Smad2作为TGF-β信号通路中的关键成员,也是其他多个信号通路的交叉点,尤其是近来研究证实Smad2与上皮的间质转变过程以及肿瘤的侵袭转移关系甚为密切,以抑癌作用参与恶性肿瘤的发生发展过程。这些现象似乎提示Smad2有可能接受了miR-455-3p的高表达抑制,通过转录后调控,抑制了 Smad2的蛋白表达,促进了肺癌的侵袭转移。因此,我们提出miR-455-3p有可能参与了肺癌的发生发展过程的假说,并且认为miR-455-3p可能通过Smad2调控肺癌细胞侵袭。   本研究拟定通过两部分探讨miR-455-3p如何参与调控肺癌细胞侵袭能力的变化。首先,检测miR-455-3p在非小细胞肺癌中表达的意义,以及与非小细胞肺癌患者预后生存期关系;其次,揭示miR-455-3p通过直接抑制靶基因Smad2,促进了肺癌细胞的侵袭。   材料与方法:   一、NSCLC病人及组织样品   90例非小细胞肺癌(NSCLC)和癌旁肺组织(癌旁肺组织LCA,距离癌组织达5cm以上)为2008年至2009年中国医科大学附属第一医院及辽宁省肿瘤医院收治的病人。64例有随访结果的非小细胞肺癌为2003年至2004年辽宁省肿瘤医院收治的病人。所有病人术前未接受任何放化疗治疗。常规病理检查手术切除的肺门、纵膈以及肺内淋巴结,用于确定肺癌的淋巴结转移情况。患者的临床病理资料包括性别,年龄,发病部位,肿瘤体积,组织学类型,组织学分级,淋巴结转移、病理分期,摘自患者的病历资料。90例非小细胞肺癌包括:男性63例,女性27例;年龄40~78岁(中位年龄59岁);发病部位:右肺50例,左肺40例;肿瘤体积0.5cm~8cm(中位数3.5cm);鳞癌44例,腺癌46例;组织学分级:高分化30例,中分化32例,低分化28例;淋巴结转移43例,无淋巴结转移47例,病理分期Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ期分别为32例、40例和18例。64例有随访结果的非小细胞肺癌病人随访截止时间2009年12月31日,中位随访时间43.5个月。   二、细胞系和细胞培养   冻存于液氮的LTE-a-2(LTE),SPC-A-1(SPC),A549,LK2,NCI-H460(H460),HBE经复苏后,用DMEM(含有10%新生牛血清)或1640培养液(含有10%新生牛血清,100u/ml的青霉素和100μg/ml的链霉素),在37℃,5%CO2饱和湿度条件下培养,经3次传代稳定后,进行转染。   三、细胞瞬时转染和转染效率及浓度测定   用5ul转染试剂(Dharma FECT4)将10nM、20nM、30nM pre-miR-455-3p或anti-miR-455-3p以及miR-negative-control(标记FAM荧光标签)转染入6孔板中,细胞密度为70%,收集相应时间点终止细胞培养,为总RNA、蛋白质提取和Transwell迁移、侵袭实验备用。实验组包括pre-miR-455-3p和anti-miR-455-3p,对照组包括为未加任何处理因素(untreated)和pre-miR-negative-control和anti-miR-negative-control。8-12h后FCM监测转染效率,培养24h,48h用于后续实验。   四、 Real-time RT-PCR   miRNA定量检测采用TaqMan MicroRNA real time RT-PCR相对定量方法。利用TaqMan MicroRNA Reverse Transcription Kit(Applied Biosystems)合成特异性的miR-cDNA,在基因扩增仪(G-Storm,英国)内完成反转录过程。real time PCR在Applied Biosystems7900HT Fast Real-Time PCR System(Applied Biosystems,USA)内完成。按照TaqMan MicroRNA Assays Kit(Applied Biosystems)优化程序进行扩增。miR-455-3p(PN:4427975),U6 snRNA(PN:4427975)作为内参对照。实验组及对照组均设2次重复。   五、RT-PCR   TRIzol试剂提取转染后24h各组织总RNA,紫外分光光度计测定RNA纯度并定量,在1.2%琼脂糖凝胶电泳验证RNA完整性。取5ug RNA运用InvitrogenMMLV逆转录酶(Cat No:28025-013)及相关试剂进行逆转录反应,反应体系为20ul,实验步骤参照(Invitrogen Cat No:28025-013)中的步骤进行。根据基因信息,运用Primer Premier5.0软件,设计上下游引物,Smad2的引物为5-TGC CTAGAT CAA GAA GCA G-3(forward)和5-TGC CTA GAT CAA GAA GCA G-3(reverse).PCR反应体系50ul,反应条件:94℃3mins,94℃40s,56℃60s,72℃60s,以上25个循环,72℃充分延伸10mins。取5ul扩增产物进行1.0%琼脂糖凝胶电泳,进行半定量RT-PCR验证,以β-actin(PCR产物长度为500bp)为内参,UVP图像处理系统采集图像,ImageJ灰度分析软件进行条带灰度分析。   六、Western blot检测   提取转染后48h各组织蛋白,根据蛋白的分子量制备不同浓度的SDS—聚丙烯酰胺凝胶,每孔上样量50μg,常规电泳、转膜、封闭,一抗4℃孵育过夜,相应HRP-羊抗兔IgG二抗室温孵育2h,β-actin作为内对照。Western Lightning(R)-ECL,Enhanced Chemiluminescence Substrate(Perkin Elmer,NEL100001EA)检测,显影。UVP图像处理系统采集图像,ImageJ灰度分析软件进行条带灰度分析。以平均吸光度值INT和信号面积S的乘积代表信号强度。分别计算不同指标和β-actin的INT×S,用二者的比值显示不同指标的表达水平。   七、报告基因实验   以A549细胞的cDNA文库为模板,扩增得到含有miR-455-3p预测靶位点的Smad2-3UTR序列。Smad2上、下游引物:5CGCGGATCCACAACTCTTCTGTCATAGC3和5CCGGAATTCTGCCTAGATCAAGAAGCAG3。利用 BamHI及EcoR(I)酶切后连接到pcDNA3-EGFP荧光报告载体中(pcDNA3-EGFP-Smad2)。利用基因定点突变试剂盒构建含有突变靶位点的荧光报告质粒(pcDNA3-EGFP-Smad2-mut)。实验组分为:pcDNA3-EGFP-Smad2和pre-miR-455-3p;pcDNA3-EGFP-Smad2和anti-miR-455-3p;pcDNA3-EGFP-Smad2-mut和pre-miR-455-3p;pcDNA3-EGFP-Smad2-mut和anti-miR-455-3p;对照组包括:pcDNA3-EGFP-Smad2;pcDNA3-EGFP-Smad2-mut;pcDNA3-EGFP-Smad2和pre-miR-negative-control;pcDNA3-EGFP-Smad2和anti-miR-negative-control。转染48小时后,于荧光Fluorescence spectrophotometer F4500(Hitachi,Tokyo,Japan)观测绿色荧光信号变化。   八、Transwell细胞迁移和侵袭实验   Transwell小室上、下室之间滤膜孔径为8um,细胞转染24h后,以0.25%胰蛋白酶消化收集。Transwell小室的上室加入200ul用无血清培养基制成的2.5×10个/ml的单细胞悬液,下室加入500ul完全培养基,37℃、5%CO2孵箱培养;不同细胞系按不同时间终止培养后,PBS洗涤2次,以棉签小心刮除滤膜上室面的细胞,室温下风干Transwell小室,0.1%结晶紫染色30min,33%醋酸脱色,选择570nM波长,于酶联免疫检测仪上检测吸收值,判定细胞的迁移程度。每种细胞进行三次平行实验。侵袭实验时在Transwell膜的上室面包被50ul预冷无血清培养基稀释的人工基质胶(Matrigel),37℃保温2小时,余步骤同细胞迁移实验。   九、统计学分析   Real-time RT-PCR数据结果,即miR-455-3p的表达水平以2-△Ct表示。癌与癌旁表达水平以2-△△Ct进行比较,△△Ct=△Ct癌miRNA-△Ct癌旁miRNA,Mann-Whitney U检验比较癌与癌旁表达水平的差异性(2-△△Ct)。Sepearman相关性检验比较miR-455-3p表达(2-△Ct)与非小细胞肺癌患者性别,年龄,肿物部位,肿物体积,病理分型,分化程度、淋巴结转移、病理分期的相关性。   miR-455-3p的预后统计分析,Kaplan-Meier单因素分析非小细胞肺癌中性别,年龄,肿物部位,肿物体积,病理分型,组织学分化,淋巴结状况,临床病理分期以及miR-455-3p表达水平对总生存率的影响,多因素COX模型分析非小细胞肺癌的独立性影响因素。其他采用t检验进行数据分析,用mean±SD表示。   所有统计数据均应用SPSS16.0进行分析,p<0.05有统计学意义。   实验结果:   一、miRNA array筛查NSCLCs与LCAs中miRNAs表达差异性   采用miRCURYTM LNA Array分析6例NSCLCs(3例鳞癌,3例腺癌)组织与LCAs组织中700个miRNAs表达(v.11.0)的差异,筛选出癌与癌旁组织表达差异在10倍以上的miRNAs,结果显示:鳞癌中共同高表达11个,低表达1个;腺癌中共同高表达16个,低表达22个。其中miR-31*在鳞癌及腺癌中均为高表达,miR-34c-5p在鳞癌和腺癌中均为低表达。   二、90例NSCLCs和LCAs中miR-455-3p表达水平比较   采用TaqMan real time RT-PCR相对定量方法检测miR-455-3p在90例NSCLCs和LCAs中表达情况,结果显示:NSCLCs中miR-455-3p表达高于LCAs组织2倍以上(以2-△△CT表示)者占66.7%(60/90)。Mann-Whitney U检验结果显示NSCLCs中miR-455-3p表达水平比LCAs表达水平高(p=0.03)。   三、miR-455-3p在NSCLCs组织中表达的意义   采用sepearman相关性检验分析了miR-455-3p表达高低水平与90例NSCLCs发病年龄,性别,发病部位,肿物大小,病理诊断,分化程度,淋巴结转移,病理分期的相关性。结果显示:miR-455-3p表达高低与分化程度呈负相关(r=-0.477,p=0.00);与pTNM(r=0.334,p=0.01)和淋巴结转移(r=0.407,p=0.00)呈正相关。miR-455-3p表达高低与NSCLCs患者性别、年龄、发病部位、肿瘤体积、病理分型等均无相关性。   四、miR-455-3p表达高低与64例NSCLCs患者预后关系   为了进一步研究miR-455-3p与NSCLCs预后生存期关系,我们检测了有随访结果的64例NSCLCs组织miR-455-3p表达。用Kaplan-Meier生存分析性别、年龄、发病部位、肿物大小、病理分型、分化程度、淋巴结转移、病理分期、miR-455-3p表达高低与NSCLCs患者5年累积生存率的结果发现:分化程度低(4.8%)的NSCLCs患者5年生存率低于中分化(13%)和高分化(30%)的NSCLCs患者(p=0.02)、淋巴结转移(0%) NSCLCs患者5年生存率显著低于无淋巴结转移(36.8%)的NSCLCs患者(p=0.00)、病理分期为Ⅰ期的NSCLCs患者(40.9%)5年生存率依次高于Ⅱ期(4.8%)和Ⅲ期(0%)的NSCLCs患者(p=0.00)以及miR-455-3p表达高的NSCLCs患者5年生存率(3.2%)显著低于miR-455-3p表达低(27.3%)的NSCLCs患者(p=0.01)。性别、年龄、发病部位、肿物大小、病理分型与NSCLCs患者5年生存率没有趋势性关系。   单因素分析中对NSCLCs患者预后有影响的四个因素进行多因素COX模型分析。采用Backward: Wald方法分析的结果显示:淋巴结转移和病理分期是影响NSCLCs患者预后的独立因素,而miR-455-3p表达高低和分化程度不是影响NSCLCs患者预后的独立因素。   五、miR-455-3p靶基因预测   应用目前常用miRNA的靶基因的预测软件Targetscans;Miranda;Diana三种对miR-455-3p靶基因进行预测,筛选出重复性较高并经KEGG软件预测有功能的靶基因于有:ACVR2B、EI24、HDAC2、 PIK3R1、SMAD2我们选择了肺癌细胞LTE、SPC、A549,通过转染pre-miR-455-3p或anti-miR-455-3p,转染效率达到60-70%,经RT-PCR和Western blot分别检测了预测靶基因Smad2的表达水平的变化。   六、miR-455-3p在非小细胞肺癌细胞系中的表达   采用Taqman real-time RT-PCR检测了5种肺细胞系A549,SPC-A-1,NCI-H460,LTE,LK2和人永生化正常支气管上皮细胞(Human bronchiolarepithelium cell line, HBE)中miR-455-3p的表达情况,HBE作为正常对照细胞系, miR-455-3p在6种细胞系中的表达水平比较,结果显示:A549,SPC-A-1,LTE表达水平高于HBE2倍以上,而NCI-H460,LK2表达水平与HBE相当,于是,选择SPC-A-1,LTE,A549为进一步研究的细胞系。   七、miR-455-3p对预测靶基因Smad2表达的影响   我们选择了肺癌细胞LTE、SPC、A549,通过转染pre-miR-455-3p或anti-miR-455-3p,转染效率达到60-70%,经RT-PCR和Western blot分别检测了预测靶基因Smad2的表达水平的变化。   LTE、SPC细胞中分别转染pre-miR-455-3p,结果显示:Smad2的mRNA表达程度没有明显变化(PLTE=0.594;PSPC=0.106),Smad2的蛋白质表达被抑制,PLTE=0.007,p<0.01,有显著的差异性,PSPC=0.02,p<0.05;转染anti-miR-455-3p后,LTE和SPC的mRNA表达程度同样没有明显变化(PLTE=0.297;PSPC=0.548),但是Smad2蛋白表达增强,PLTE=0.003,p<0.01,有显著的差异性,PSPC=0.02,p<0.05。为进一步说明这一现象的普遍性,A549细胞对于miR-455-3p的表达水平最高,差异性最显著,我们同样观察到在转染anti-miR-455-3p后,Smad2的mRNA轻度增加,p=0.051,统计学意义不明显,但是Smad2的蛋白表达升高显著,p=0.005,p<0.01,有显著的差异性。   八、miR-455-3p对EGFP标签的预测靶基因Smad2的作用   软件预测分析了Smad2与miR-455-3p的相互作用的靶位点,构建EGFP-Smad2及预测与miR-455-3p结合位点突变的Smad2(EGFP-Smad2-mut)的3UTR全长报告基因。选择高表达miR-455-3p的A549细胞作为研究背景细胞。共转染EGFP-Smad2和pre-miR-455-3p或anti-miR-455-3p的结果显示,可以引起荧光信号的变化,抑制剂组绿色荧光信号增强显著,而前体组也轻度下降,既发生了miR-455-3p与Smad2的位点直接结合;共转染EGFP-Smad2-mut和pre-miR-455-3p或anti-miR-455-3p的结果显示,绿色荧光信号没有显著变化,既没有发生miR-455-3p与Smad2的位点直接结合。   九、miR-455-3p通过Smad2调控肺癌细胞的侵袭   以高表达miR-455-3p的A549作为研究背景细胞,转染anti-miR-455-3p组与未处理对照组和负对照组比较的迁移和侵袭实验结果显示,下调miR-455-3p,A549的迁移侵袭率下降,细胞迁移侵袭能力下降,经酶标仪检测结晶紫吸收值,p<0.05,有统计学差异性。进一步说明这一现象,我们又选择中等程度表达miR-455-3p的肺癌细胞LTE作为研究背景,以前述的方法转染进行下调内源性的miR-455-3p表达水平。同样的结果显示,转染了anti-miR-455-3p的实验组中,无论是迁移实验,还是侵袭实验,与未处理组和负对照组比较,LTE穿过Transwell小室的细胞率下降,迁移和侵袭能力都呈现下降变化,酶标仪检测结晶紫吸收值,p<0.05。转染pre-miR-455-3p的LTE细胞中,与未处理对照组和负对照组比较,迁移和侵袭实验都呈现细胞的迁移侵袭率增多,迁移侵袭能力增强。经酶标仪检测结晶紫吸收值,p<0.05。   miR-455-3p促进了肺癌细胞的迁移侵袭,抑制Smad2的表达。miR-455-3p是否依赖于抑制Smad2表达促进了肺癌细胞的迁移侵袭,我们对高表达miR-455-3p的A549中转染了anti-miR-455-3p,结果发现miR-455-3p被抑制,Smad2表达升高,细胞迁徙侵袭能力下降。用Smad2单抗阻断Smad2后,转染anti-miR-455-3p,细胞迁移侵袭能力并无明显下降。   结论:   1、miR-455-3p在NSCLCs组织中高表达,与其分化程度和患者预后生存率呈负相关,与淋巴结转移、病理分期呈正相关。   2、miR-455-3p通过直接抑制靶基因Smad2促进了肺癌细胞的侵袭能力。
其他文献
全国名茶展评会于6月4日一6月8日在南京举行。参加这次会议的有来自16个省65个单位的代表和列席代表共93人。参加展评会的茶样76个。共评出名茶11个,计天柱剑毫、岳西翠兰、
沙子从哪里来?rn要回答这个问题,需要大家先想一想你都在哪些地方见过沙子呢?河床?海滩?沙漠?建筑工地?甚至是小时候玩的沙漏玩具、爸爸练拳用的大沙包,或者糖炒栗子的大锅里
期刊
中华人民共和国成立70周年阅兵式上,东风-41弹道导弹正式亮相,引发国内外媒体强烈关注.东风-41弹道导弹是中国研发的第四代战略导弹,也是最新的一代.它可携带十枚分导式弹头,
期刊
井岗翠绿是江西省井岗山县特种名茶之一,产地位于罗霄山脉中段的革命摇篮井岗山茨坪、大井、桐木岭一带,海拔一千三百公尺。巍巍井岗,主峰挺拔,翠峰迭嶂,山峦起伏,蜿蜒五百
在过去4.39亿年间,地球上发生了5次物种大灭绝,每一次都把当时的生物清扫了50%~95%,包括那些占优势的生命形式,最近一次遭殃的就是恐龙.研究证明灭绝事件之后要经过1 000万年,物
期刊
冰雪为容玉作胎,柔情合傍琐窗开;rn香从清梦回时觉,花向美人头上开.rn——清代王士禄rn“好一朵美丽的茉莉花,芬芳美丽满枝丫,又香又白人人夸,让我来将你摘下,送给别人家.”
期刊
流言:5G时代网络通信速度非常快,因此家中、单位里使用的Wi-Fi网络再无用武之地,可以丢弃了。  真相:5G和Wi-Fi各有优点,目前阶段互为补充才是最佳选项。5G网速的确超过了现在的干兆家庭互聯网宽带,但对于室内环境的信号渗透有所不足,而室内网络通信恰恰是Wi-Fi的强项,有它的用武之地。  1G频率为800MHz,而5G频率可达4900MHz。电磁波频率越高,波长越短,衰减也越快,更容易被障
期刊
看到蝎子、蜘蛛的你,是不是会顿时屏住呼吸、面色凝重,甚至尖叫?然而它们的远祖竟然还有点萌,拇指大小的身体,头上长着好多“脚”,还有着一双萌萌的卵形大眼,整个儿看起来就像一只可爱的皮皮虾。而嘴边的一对“小钳子”则暴露出了它们的真正身份——这类生物均属于螯肢动物。  2019年,《自然》杂志发表了一项中国科学院南京地质古生物研究所的新发现,研究人员在寒武纪中期布尔吉斯页岩动物群中发现了一种莫里森虫新物
期刊
昨天,记者从海淀区房管局获悉,海淀区在全市率先推出房地产经纪行业动态监管系统,将海淀区经纪机构和从业人员信息全部纳入监管,市民只要登录海淀房管局网站(http://hdfgj.bi
6500万年前,一颗巨大的小行星撞击了地球,在这场全球性灾难中,恐龙灭绝了,但接下来发生了什么?生命又是如何复苏的?  美国丹佛自然与科学博物馆科学家的惊人发现,揭示了世界和生命如何在这场灾难事件中恢复的细节。  最近,在《科学>发表的一篇论文中,科学家描述了在科罗拉多州中部康瑟尔布拉夫斯发掘的一批化石。  他们提到在小行星撞击地球后关键的100万年中,保存完好的动植物化石揭示了地球上最黑暗的日子
期刊