当今是全球一体化的时代,跨区域合作成为主流,是现阶段中国经济发展的重要特征。国家、省域、市域之间的依赖性与纽带不断强化,彼此相互合作,且相互竞争。基于此,形成的以政府间竞争为主要特征的区域治理模式和体制机制为区域协调发展战略提供了强劲的推动力,也为地方政府指引了一条纾解区域经济协调发展难题的有效路径。区域政府协同治理已取得骄人的成绩,但同时,也要清楚地了解到,我国区域发展差距依旧较大,难以适应新时期实施区域协调发展战略的需要。因此,现阶段,在我国区域协调发展中合理、有效地运用协同治理是必要且可行的,且政府作为协同治理的重要主体,仍具有不可替代的宏观调控作用。跨区域协同治理是地方政府促进区域经济发展的必然选择,必须依托新的大局形势、新的时代任务,提出创新思路和新型发展模式引导区域经济协调发展。目前,中国经济正从高速发展走向高质量发展,现代经济体系中的现代产业体系作为其基础和核心,是加速变革经济发展方式、促进区域经济协调发展的迫切要求。但当前成渝地区双城经济圈现代产业体系在实体经济、科技创新、现代金融和人力资源领域还存在着产业同质化竞争、科技创新能力相对落后、产业结构低端化以及就业结构失调等问题,催生出跨区域地方政府协同治理的需求。虽然自成渝地区双城经济圈上升为国家战略后,地方政府合作意识日益增强,逐渐探索经济区与行政区适度分离、推动区域法治和政策协同以及提供多方位公共服务保障,在协同构建现代产业体系上有显著的成果,但跨区域问题的复杂性、广泛性和突发性,使得地方政府面临着竞合困境、执行困境以及联动困境。基于此,本文聚焦跨区域地方政府协同治理领域,同时运用协同治理理论、府际关系理论和产业结构理论分析探讨出产生治理困境的主要原因在于政府协同治理体制机制不健全、区域法治体系不完善以及政府宏观调控不到位三方面。本文还甄别遴选了京津冀打造的“2+4+46”个产业承接平台、长三角采用的“飞地经济”模式以及粤港澳大湾区推动“一核一带一区”区域格局为优化成渝地区双城经济圈政府协同构建现代产业体系的典型案例。结合三地的治理实践,本文认为成渝经济圈在构建现代产业体系过程中应加快产业结构调整,应注重强化成渝两地的双核辐射作用,创新产业政策发展“飞地经济”,优化产业空间结构和资源配置,形成错位协调发展的现代产业体系发展格局。最后,本文以协同治理理论、府际关系理论和产业结构理论为理论指导,结合成渝地区双城经济圈发展实际,以期在新的战略形势下,提出进一步提高成渝地区双城经济圈地方政府协同治理的效能和效率,推动现代产业体系协同构建的优化对策。本文认为地方政府作为区域经济发展的主导力量,应凭借其政治力量,发挥其在协同治理中的主体和支配作用,从体制机制、区域法治、宏观调控三个方面完善与区域现代产业体系发展相匹配的政府协同治理体制机制、区域法治保障和区域一体化规划,协同优化成渝地区双城经济圈现代产业体系结构布局,擘画“实体经济、科技创新、现代金融、人力资源”四位一体的现代产业体系协同构建格局。