基于形态指标和SSR标记的香椿品种分类研究

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香椿(Toona sinensis)是一种原产中国的高大树木,其嫩芽芳香浓郁,风味独特,自古以来就是一种高档季节性蔬菜。一直以来,香椿的品种分类不清楚,生物遗传特性缺乏认知,不利于香椿产业的发展。本实验收集来自山东、山西、安徽、四川等10个省份17个地区的香椿品种作为研究对象,通过形态学指标、同工酶鉴定和EST-SSR分子标记方法,对不同地域来源香椿品种之间的亲缘关系进行了分析比较,主要结果和结论如下:(1)形态学观察通过对香椿12个外观性状进行观察,结果显示,香椿形态指标变异丰富,各样本之间性状差异较大,各性状之间存在显著的相关性。对香椿进行聚类分析,来自山东省潍坊市的青州红香椿(编号为4)和临朐红香椿(编号为5)的亲缘关系最近,地理位置最近,而来自河北省河间市的香椿(编号为7)和重庆木椿(编号为9)亲缘关系最远。以欧式距离为基础,将]7个来源地的香椿品种分为5大类,7个亚类。(2)同工酶分析通过过氧化物酶(POD)和多酚氧化酶(PPO)同工酶分析,在欧式距离的基础上对17个香椿样本进行系统聚类,将17个来源地的香椿品种分为6大类,8个亚类。(3)2C值测定通过流式细胞仪对青油椿、巴山红、黑油椿进行香椿基因组大小的分析,以黄瓜为参比,确定青油椿、巴山红、黑油椿的基因组2C值分别为585Mbp、570 Mbp、583 Mbp。使用安康产的香椿种子催芽进行香椿染色体核型分析,确认香椿共有28对,56条染色体,为2A型。(4)转录组分子分类通过Illumina HiSeq转录组测序结果,对SSR位点进行分析,共设计了 70399对引物,从中选取出10对引物,进行PCR扩增,其中有6对引物扩增出了清晰的条带,总共扩增出25条多态性条带,平均每对引物可扩增出4.2条谱带。对扩增出的条带,以欧式距离为基础进行系统聚类分析,将17个来源地的香椿品种分为4大类,8个亚类。
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