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酸枣是鼠李科枣属植物,为我国特有的重要生态经济型树种,良种缺乏为产业发展的限制因素,通过种质资源调查开展选择育种为酸枣遗传改良的重要途径。本文以辽西朝阳地区的53个优选酸枣种质和8个当地大枣品种作为研究对象,通过表型性状观测（14个质量性状和28个数量性状）、SSR-PCR扩增试验,研究其遗传多样性,建立指纹图谱,旨在为酸枣种质资源发掘及良种选育提供科学依据。主要研究结果如下:（1）供试的酸枣种质在表型性状上表现出了丰富的遗传多样性,28个数量性状的变异系数在8.5%-104.5%之间,变异幅度较大,说明酸枣良种选育的潜力较大。14个质量性状的频率分布也反映出酸枣种质资源的表型性状多样性;采用主成分分析与聚类分析相结合的方法,将供试种质分为3类,其中第1类的特征为果实大小中等,叶片较大,为介于大枣与普通酸枣之间的过渡酸枣类型;第2类均为大枣品种;第3类的特征为果实较小,以红色为主,接近普通酸枣类型。（2）采用L16（45）正交试验,建立了适合酸枣的SSR-PCR反应体系（总体积20μL）:DNA模板量100 ng、引物浓度0.5μmol·L-1、Mg2+1.25 mmol·L-1、Taq聚合酶量1.5 U、dNTPs 0.3 mmol·L-1;从60对引物中筛选出35对作为酸枣SSR分子标记研究的引物。（3）筛选出的35对引物多态性较高,每个位点平均等位基因数（NA）为8.6,有效等位基因数（NE）为3.723,多态性信息含量（PIC）平均值为0.661;平均期望杂合度（HE）为0.698,观测杂合度（HO）为0.327,说明供试种质杂合性低;遗传相似系数在0.67-0.98之间,供试种质亲缘关系较近,遗传差异较小。（4）基于SSR标记的UPGMA法和STRUCTURE数学模型法聚类分析表明,供试种质可分别划分为4类和3类。卡方检验表明,基于SSR标记的两种聚类结果呈现极显著相关（Sig<0.01）,而基于表型性状的聚类结果与基于SSR标记的两种聚类结果的相关性均不显著（Sig>0.5）。（5）以引物扩增条带容易分辨、应用的引物尽量少为原则,选择7对引物扩增谱带的组合建立了酸枣种质DNA指纹图谱,7对引物分别是BFU0183、JSSR88、JSSR102、JSSR239、JSSR222、JSSR262和JSSR207。综上,本研究基于表型性状将供试种质划分为3类,优化了酸枣SSR-PCR反应体系,建立了酸枣DNA指纹图谱,这些研究结果为酸枣种质资源的发掘、保护以及优异种质的选择提供了科学依据。