新疆是我国绵羊品种最多、遗传品质最复杂的省区,在长期生产实践中育成了许多具有特色的地方品种,这些品种是世界动物资源开发和利用的宝贵财富。如哈萨克羊具有体大早熟、抗逆性强、适应性强等优良性状;阿勒泰羊是哈萨克羊的一个优良类群,具有体格大,羔羊生长发育快,增膘快,产肉脂量高的特点;巴什拜羊具有早熟、耐粗饲、适应性强,被毛呈棕红色,绒毛多,干死毛少等特点。这些地方品种是保护生物多样性的重要物种资源,是实现我国养羊业可持续发展的基础。本研究在国内首次运用AFLP标记从分子水平阐明了新疆哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊品种资源的多态性,为地方品种的保护和合理利用提供科学依据。本实验利用AFLP标记技术对新疆哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊进行了遗传分析,统计了每对引物组合在各品种中检测到的总条带数和多态性条带数,计算了3个地方品种绵羊的遗传相似系数及遗传距离,并据此构建了UPGMA聚类关系图。研究结果如下:1.比较了沸水浴法、Miller盐析法、CTAB法及改进的酚法对绵羊基因组DNA的提取质量,结果沸水浴法所提取DNA的纯度和浓度效果最差,改进的酚抽提法同Miller盐析法、CTAB法相比所提取的DNA产物纯度和浓度差异显著( P < 0.05),适宜用于AFLP分子标记技术对DNA模板的实验要求。2.本研究共对64对MseI和EcoRI引物组合进行多次重复筛选,其中均扩增出条带多且多态性百分率高、带型丰富、条带清晰的引物组合11对(E01/M02、E01/M07、E02/M02、E04/M01、E05/M05、E05/M08、E06/M02、E06/M04、E06/M05、E07/M03、E07/M08)。在3个地方绵羊品种中共检测到527条带,平均每个引物组合产生47.91条,变化范围在34～61条,其中多态性条带总数为46条,占扩增总带数的8.73%,每对引物平均扩增多态性带4.18条。表明我国新疆地方绵羊品种遗传多样性较为丰富。3.筛选的11对应物中其中多态性条带较多的应物组合为:E01/M02(7条)、E07/M08(6条)、E06/M02(5条)、E06/M04(5条)、E07/M03(4条)、E02/M02(4条)、E05/M08(4条)。4.根据11对AFLP引物组合的检测结果,计算了新疆3个地方绵羊品种的遗传相似系数,其中哈萨克绵羊与阿勒泰绵羊的遗传相似系数最大(0.699),哈萨克绵羊与巴什拜绵羊遗传相似系数最小(0.592),阿勒泰绵羊与巴什拜绵羊为(0.620)。表明我国地方绵羊品种之间有较高的遗传相似性,遗传变异频率不大。5.利用NTSYSpc软件的UPGMA法,对我国新疆3个地方绵羊品种进行聚类分析,构建了UPGMA聚类图。