鼻咽低分化鳞状细胞癌分子分类的初步研究

来源 :第一军医大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:jojo0911216779
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是我国南方五省及东南亚地区常见的一类恶性肿瘤。病因学研究表明,遗传因素、环境因素和EB病毒感染均与NPC的发生有关。由于NPC的组织形态学比较复杂,目前对于NPC的病理学分型尚未有统一的认识,存在多种组织病理学分类方法。临床上,98%的NPC病例都属于低分化鳞状细胞癌,这种组织学特性决定了放射治疗是其主要的治疗手段。但治疗效果不是很理想,预后较差,5年生存率不超过60%。这种临床异质性提示了鼻咽低分化鳞状细胞癌很可能存在不同的分子亚型。 肿瘤的分子分类是指,以基因表达谱为根据,运用相关的分子生物学技术,结合一些计算机数据处理方法,筛选出数个或数十个肿瘤标志物,用以找出人类未知的肿瘤亚型和/或将一些特殊的肿瘤病例归入到已发现的肿瘤类型中,从而在分子水平上区分肿瘤的类型,以便更好地指导肿瘤的早期诊断,个性化治疗以及预后评估。这已成为肿瘤分子病理学中一个重要的研究方向。 cDNA微阵列或基因芯片(cDNA microarray or gene chip)技术不仅可高敏感地定性、定量的检测基因表达水平,其最大的优越性是可同时对成千上万个基因的表达情况进行检测或平行对比这些基因在不同组织中的表达,被认为是一种高通量的基因表达水平的检测方法。因此,cDNA微阵列技术可以成为肿瘤分子分类的主要手段之一。 本研究选用24例病理诊断为鼻咽低分化鳞状细胞癌且癌细胞数量超过细胞总量75%的鼻咽癌组织、24例作为对照的正常鼻咽组织及4种鼻咽癌细胞系进行研究,分别抽提各组织和细胞系的总RNA,并从24例正常鼻咽组织标本中分别取等量的RNA混合在一起作为一个共同的对照,经逆转录a一’ZP一deTP标记探针后,分别与Researeh Geneties公司生产的具有4132个人类已知功能的基因(包括表达序列标签,ESTs)的微阵列膜GFZH进行杂交,再利用该公司所配套的分析软件Pathways4.0对杂交强度进行分析,数据均一化后,分别得到24例鼻咽低分化鳞状细胞癌组织、鼻咽正常组织及4种鼻咽癌细胞系的41犯个基因的表达谱。 根据24例鼻咽低分化鳞状细胞癌组织和正常对照组织的基因表达灰度值,对每个基因进行t一test,共筛选出基因表达灰度值具有显著差异(P<0.05)的基因1625个。其中在鼻咽低分化鳞状细胞癌组织中表达基本上调的基因有114个,如基本转录因子3(B7子咨)、细胞周期素Dl(cCNDI)等;24例鼻咽低分化鳞状细胞癌组织表达基本下调的基因有42个,如细胞死亡调节蛋白GR从fl夕、翻译抑制蛋白尸14.J、表皮膜蛋白2等。 同时,将鼻咽癌组织和鼻咽癌细胞系的基因表达谱进行比较,筛选出在鼻咽癌组织中表达而鼻咽癌细胞系中不表达的基因50个,初步将其看作鼻咽癌组织间质细胞表达的基因。 基于4132个基因和1625个基因的表达谱,运用Cluster软件,分别对24例鼻咽低分化鳞状细胞癌标本进行聚类分析,二者聚类结果一致,同样将24例标本分成两类:NPC 101、105、106、110、112、113、一15及121标本聚成一类,而NPC102、103、104、107、108、109、111、114、1 16、1 17、1 18、1 19、120、122、123及124聚为一类。根据聚类结果,又筛选出两类间表达灰度值具有显著差异(P<0.05)的基因78个,对这78个基因再次进行聚类分析,结果与4132个及1625个基因的聚类结果一致,此结果也表明这78个基因基本上可以概括鼻咽低分化鳞状细胞癌分子分类的信息。将这78个基因与前面筛选的在间质细胞中表达的50个基因进行对比,未找到相同的基因,因此初步将它们作为鼻咽低分化鳞状细胞癌分子分类的候选指标。结合数据库信息发现这些基因的功能主要与转录调节、细胞生长和周期调节、信号转导、碳水化合物和蛋白质代谢等有关, 本实验结果表明:在鼻咽癌组织中,有多个基因的表达水平发生了改变,这些基因很可能是鼻咽癌发病过程中的重要参与者;同时鼻咽低分化鳞状细胞癌在分子水平上,可能至少存在两种亚型,在两种亚型中有多个基因的表达水平发生了变化,这些基因的功能主要集中在转录调节、细胞生长和周期调节、信号转导、碳水化合物和蛋白质代谢等方面。
其他文献
铁皮石斛(Dendrobium officinale)作为我国一种传统中药,其药用历史非常悠久,最早记载于《神农本草经》中。铁皮石斛野生资源已经濒临灭绝,现在市场上销售的铁皮石斛种以栽培模式为主。不同产地、不同种源、不同居群的铁皮石斛的在药材品质、外观性状、遗传信息等方面存在差异,同时铁皮石斛的栽培存在种源背景不清晰、不同产地之间互相引种等问题,难以判断药材的来源与品质,给铁皮石斛的种质资源带来一
断层是中拐凸起最主要的油气输导体,对该地区的油气成藏起着至关重要的控制作用,定量研究中拐地区断层启闭性对认识油气分布、成藏过程及成藏模式均具有非常重要的意义。本文
济源市位于河南省西北部,近年来,市农技部门创新方式,通过加快构建农技推广新模式、加强新型农业经营主体培训、强化示范引领等方式,搞好新型农业经营主体服务,取得了明显成
<正>像电影中展示的一样,太空旅行充满着各种不确定性,你可能会遭遇携带的氧气耗尽,火箭故障等一系列问题,还有可能会碰上快速飞行的太空垃圾刺穿太空船船体。科学家为解决这
期刊
<正> 我们美丽的祖国是一个多民族的伟大国家,在中华民族五千年的文明史上,少数民族同胞与汉族一起,用自己的勤劳与智慧,为中国美术史谱写了无数动人的篇章。从辽阔的内蒙古
第一课堂与第二课堂融合发展是高校实现"三全育人"模式创新发展的重要基础。空中乘务专业专业立足于将学生培养成既有深厚的航空服务理论知识,又有扎实的航空服务实务技能的
<正>记得第一次捧起《堂吉诃德》,我就被里面的情节所深深地吸引住了,每天都幻想着自己是一名骑士。但真正的骑士是什么样呢?直到后来上体育课我才体会到。那是一次体育课,老
随着互联网技术的蓬勃发展,云计算信息时代已经到来。而支撑云计算技术的基础是部署在世界各地的多个大量的物理服务器的数据中心。因此高效地管理数据中心的服务器,解决资源管理调度问题始终是重中之重。资源调度问题面临的挑战是多方面的。第一,资源调度的整个流程十分繁杂,往往难以精准建模。第二,资源调度的需求是可变的。第三,随着云计算的高速发展,数据中心的资源,作业和流程的规模不断扩大。越来越多的作业在数据中心
别尔嘉耶夫在《自我认知》一书中对马克思思想的相关论述集中折射出白银时代俄罗斯知识分子对于马克思主义本身的矛盾心态,而别尔嘉耶夫作为"批判的马克思主义者",在精神实践
期刊