高等教育系统是一个有机的、复杂的、统一的系统,高等教育生态系统中的各因子都是有机联系的,这种联系又动态的呈现为统一与矛盾、平衡与失衡的状态。应用生态学的原理,特别是生态系统、生态平衡、协同进化等原理与机制,研究各种教育现象及其成因,进而掌握高等教育发展的规律,揭示高等教育发展的趋势和方向,可以更好的为高等教育的未来发展提供决策依据。高等教育的生态平衡是教育生态理论的核心问题,高等教育生态系统的平衡是一种动态平衡,即高等教育生态系统表现在结构与功能上的物质、能量和信息的输出与输入必须平衡才能保持它的稳态。因此,高等教育系统的生态平衡是一种根本的价值取向,高等教育的和谐发展必须具有一种系统观、整体观和平衡观。我国高等教育自1999年连续扩招以来,招生人数急剧增加,引起了国内外的广泛关注。高等教育毛入学率从1998年的9.8%,提高到2002年的15%、2006年的22%,已经历史性地飞速跨入国际公认的高等教育大众化发展阶段。由于我国高等教育大众化阶段短暂和急促的启动,急剧的规模发展超出了高等教育资源的承载范围,带来了教育资源的大量稀释,部分生均教育资源明显不足、规模扩张与教育质量的矛盾日趋凸显、高等教育发展结构性失衡、东西部高等教育生态区域发展失衡等现象,最终导致了大众化阶段高等教育系统出现了严重的生态危机,在谋求快速发展的同时却走出了一条反生态之路,已经严重威胁着我国高等教育的可持续发展。本文以我国高等教育处于大众化阶段为背景,以生态学为视角分析我国高等教育系统失衡问题的现状与成因,坚持以生态平衡的观点来引领大众化阶段我国高等教育系统的内涵式发展,探讨维持大众化阶段我国高等教育系统生态平衡发展的对策,并提出走生态可持续发展之路是当前我国高等教育发展的理性选择。