利用CRISPR-Cas9系统构建DUSP9基因敲除小鼠胚胎干细胞系

来源 :内蒙古大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:aywjx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
小鼠胚胎干细胞(Mouse Embryonic Stem Cells,m ESCs)来源于着床前囊胚的内细胞团,具有无限自我更新能力。自1981年Martin Evans等人利用饲养层细胞和血清体系第一次建立了m ESCs细胞系,关于m ESCs体外培养体系的研究越来越受到人们关注。2008年Ying等人在化学成分明确的培养基中添加MEK抑制剂PD0325901和GSK3抑制剂CHIR99021(2i),与白血病抑制因子(LIF)组成了2i/LIF培养体系,就可以使m ESCs处于na?ve状态。2018年,Bao等人通过在化学成分明确的培养基中添加了Activin A、BMP4、CHIR99021和LIF四种因子组成了ABC/L培养体系,并成功利用该体系建立了干细胞系Advanced Stem Cells(ASCs)。通过比较ASCs和m ESCs的转录组数据后发现,Dusp9在ASCs中的表达显著上调,这一现象引起了我们的注意。基于这一发现,我们利用CRISPR-Cas9系统构建了Dusp9敲除的ASCs细胞系,并对该细胞系的多能性、DNA甲基化及发育潜能进行鉴定。进一步,我们通过实时荧光定量PCR、免疫荧光染色分别检测了Dusp9敲除ASCs细胞中DNA甲基化和糖脂代谢相关的基因和蛋白表达变化。结果如下:1.成功建立Dusp9敲除胚胎干细胞系首先我们利用连接有Dusp9-sg RNA的PX-459载体,通过脂质体将重组载体转染到ASCs细胞中,通过PCR产物测序、实时荧光定量PCR和WB等方法验证并成功获得了Dusp9敲除ASCs细胞系。2.Dusp9敲除胚胎干细胞系的转录组结果分析转录组分析结果表明,Dusp9基因敲除影响胚胎干细胞的多能性维持基因和其它相关调控基因的表达。从GSEA分析结果发现,Dusp9高表达组和低表达组之间m TOR和脂肪酸代谢等信号通路也存在显著差异。最后,利用实时荧光定量PCR技术检测了Dusp9敲除细胞系中糖代谢和脂代谢相关基因的表达变化情况。3.Dusp9敲除胚胎干细胞的多能性、DNA甲基化及发育潜能研究首先通过AP染色、实时荧光定量PCR和免疫荧光染色等方法检测Dusp9敲除胚胎干细胞的多能性,结果表明Dusp9敲除胚胎干细胞系具有干细胞多能性特征,仍表达Oct4和Sox2多能性特异蛋白。其次,在m RNA和蛋白水平上分别验证了Dusp9缺失导致Dnmt3B表达下降的现象。同时,体外分化实验显示,Dusp9敲除细胞系的三胚层标记基因的表达水平显著高于对照组,说明具有更高的三胚层分化潜力。更重要的嵌合体实验结果表明,Dusp9敲除细胞可以贡献到着床后胎儿和卵黄囊组织中,证明Dusp9敲除胚胎干细胞系具有多能性。综上所述,我们利用CRISPR-Cas9技术成功获得了Dusp9敲除的ASCs细胞系,Dusp9的缺失会影响胚胎干细胞的DNA甲基化和糖脂代谢等相关基因表达水平。进一步实验证明Dusp9敲除胚胎干细胞系具有干细胞多能性,能够贡献到着床后的胎儿及卵黄囊。
其他文献
随着人工电磁超材料的不断发展,广大科研工作者致力于电磁隐身斗篷等新型功能器件的设计与实现工作中。光学变换原理为此提供了有效的理论基础,也由此展开基于光学变换理论的电磁隐身器件的设计,其通过空间映射的方式来等效为虚拟空间,从而改变电磁波的传播路径,达到调控电磁波的目的,进而实现电磁隐身的目的。针对传统电磁隐身斗篷包裹目标物体在其中,无法实现内外通信的缺陷,人们提出了各种各样可以实现隐身的同时还可以进
现实生活中的各种网络,例如社交网络、交通网络、生物网络等都可以抽象为复杂网络这一理论工具进行研究.社团结构是复杂网络的重要特征之一,它将繁冗复杂的网络简化为看似相对独立却又互相联系的社团组成.对复杂网络社团结构划分的研究具有重要的理论意义与实际价值.针对复杂网络的社团结构,不同的学者基于不同的评价标准给出了相应的定义.在研究网络社团结构时,可能出现错误划分节点的现象,基于此,本文在弱社团定义的框架
本文利用间断有限体积元方法求解双曲守恒律方程.论文主要分为三个部分:第一部分,本文对间断有限体积元方法的一维格式进行构造,在文章中介绍了两种TVD限制器与一种保极值限制器的用法.为克服Minmod限制器的M自适应问题与Superbee限制器的极值处精度损失问题,本文采用第三种MPS(Maximum-principle-satisfying)高阶精度限制器.时间离散上采用了四阶的SSP Runge-
冻土是一种特殊的含冰岩土材料,其在复杂应力路径下的强度和变形问题不仅是冻土工程所面临的基本问题,而且是发展强度理论、本构理论这两个冻土力学核心问题的基础。为了深入认识复杂应力路径下冻土的受荷变形行为并进一步发展冻土力学理论,本文以冻结根河粉质黏土和冻结兰州粉质黏土为研究对象,进行了一系列试验和理论研究:(1)采用整体和局部相结合的应变测量方法,开展了子午面内直线和折线应力路径下的一系列单调和加卸载
本文从加入地形的浅水模型方程出发,讨论地形对正压Rossby孤立波的影响,并利用Gardner-Morikawa变换及摄动展开法,推导了非线性Rossby波振幅演变所满足的Korteweg-de Vries(Kd V)和Boussinesq方程。其中,利用打靶法求解变系数的具有固定边界条件的Sturm-Liouville方程,最后用傅里叶谱方法数值求解Kd V和Boussinesq方程,并画出相关
狍(Capreolus gray),分为东方狍(又称西伯利亚狍,C.pygargus)和西方狍(又称欧洲狍,C.capreolus)两种,分布于我国内蒙古地区的狍属西伯利亚狍,目前该地区狍种群数量急剧减少。本研究旨在建立狍成纤维细胞体外培养体系并分析其生物学特性,在细胞水平保护狍的物种资源,同时构建鹿科动物的系统发育树以探究鹿科动物的亲缘关系。本研究利用组织块贴壁培养法对雄性和雌性狍进行成纤维细胞
锌(Zn)/铁(Fe)元素是生物体生命活动必需的微量元素,缺乏或过量都会影响生物的生长和发育,所以必须将这些元素水平维持在一个正常的范围内。为此生物进化出可以维持金属元素稳态的调控机制,例如ZIP家族、CDF家族、PCR家族、VIT家族、YSL家族、NRAMP家族等等,其中ZIP家族被认为是主要的Zn/Fe转运蛋白。目前已经对拟南芥中15个ZIP家族成员进行了大量的研究,但是其功能及作用机制仍然没
白云鄂博矿区由于常年进行矿业活动,矿区及周边生态环境逐年恶化。调查发现苔藓植物是白云鄂博矿区主要的优势植物种类,能够吸收和富集包括稀土元素在内的重金属,对于改善矿区脆弱生态系统有着重要的意义。但是自然条件下苔藓植物的盖度和生物量非常小,使其应用价值受到严重局限。本课题选用白云鄂博矿区优势苔藓物种—丛生真藓和尖叶对齿藓的配子体为材料,探索了两种苔藓的组培快繁体系,筛选出了最优的培养条件,扩大了其繁殖
脱氧核糖核酸,是生物体内储存和传递遗传信息的基因载体,在生物体的生长发育和遗传过程中起着举足轻重的作用。在DNA纳米领域,基于DNA的序列特异性,独特的可编程性和多样性,其已经被用于许多纳米尺度结构和功能的合理设计,展现了在生物传感、逻辑运算及疾病诊断与治疗等方面突出的应用潜力。这些纳米尺度结构和功能的合理设计都是基于核酸杂交和链置换反应进行的。本论文重点研究了基于核酸杂交的动力学以及bulge结
系统发生学是研究物种进化关系的一门科学,其中系统树的构建,系统发生网络的构建,系统发生网络之间的距离计算都是系统发生学的重要研究方向。但到目前为止,没有平台能有效融合这些算法,导致研究者在构建树或网络时往往需要使用多个软件,从而耗费大量的时间和精力。本文主要对邻接法及其改进算法,Cass算法及其改进算法,计算树之间距离以及网络之间距离的算法进行了深入的研究和算法实现,并搭建了一个可视化平台,将上述