提高科技创新能力是当代各国增强世界竞争力的主要途径之一,而科技金融从设立之初就是为了促进科学技术的发展。近些年来,通过实证研究,众多学者发现科技金融能够促进科技创新能力的提高,而科技创新进步则能够带动科技金融的发展,证明了二者存在相互影响关系。科技金融与科技创新协调发展,不仅能够提高科技金融效率,而且能提升科技成果转化速度。厘清科技金融与科技创新的协调发展机制,掌握当前二者的协调状态或程度,对于我国进一步制定科技发展战略和科技金融投入政策至关重要。本研究基于协同发展理论,采用复合系统动力学分析方法,根据科技金融与科技创新自身发展特点,构建科技金融与科技创新复合系统协调发展评价模型,并建立科技金融和科技创新两个子系统及其对应指标体系,对我国首批科技金融试点地区实际数据开展实证研究。具体研究结论包括:一是,各个地区科技金融与科技创新协调发展存在不均衡现象;二是,各地区科技金融与科技创新陷入深度融合困境;三是,当前科技金融与科技创新市场仍处于初级阶段,机制不完善,政府与市场主体角色转变滞后于市场变化需求,未来协调发展受阻。鉴于科技金融与科技创新协调发展涉及面复杂且广,本文从部门设立、平台建设、政府角色转变以及科技金融与科技创新市场机制完善等方面,从顶层设计到具体实施,由上至下,逐层展开,为我国未来科技金融与科技创新协调发展提出对策与建议。本文建立的多维度、多层次科技金融与科技创新协调发展评价模型,一定程度上丰富了我国现有领域的研究,并可为未来相关政策制定提供参考。