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目的:猪流行性腹泻病毒(PEDV)是导致仔猪腹泻的罪魁祸首,仔猪被PEDV感染后会呕吐、脱水进而造成仔猪死亡,使全球的生猪养殖行业遭受重创。PEDV基因组为单股线性正链RNA,全长约28kb,属冠状病毒属成员。PEDV可以诱导细胞自噬的发生,并且细胞自噬与病毒的复制有着密切的联系,二者之间的关系十分复杂。circ RNA在病毒侵染宿主细胞时发挥着重要的功能,并且circ RNA在细胞的增殖、分化和自噬的过程中扮演了十分重要的角色,circ RNA作为诊断和治疗疾病的分子靶标具有很大潜力,探究circ RNA在PEDV侵染宿主时的调控机制,有助于寻找抵抗PEDV的新靶点。方法:(1)建立PEDV感染细胞模型,用PEDV体外分别感染IPEC-J2细胞、Vero细胞和Vero-E6细胞,运用实时荧光定量技术检测PEDV-N的相对表达量。(2)PEDV感染Vero-E6细胞24h时提取细胞总RNA,制备转录组测序样品。利用转录组测序技术对PEDV体外感染的Vero-E6细胞进行circ RNA表达谱测序分析,对获得的差异显著的circ RNAs进行生物信息学分析,并联合互作mi RNA和m RNA进一步分析。(3)将转录组测序得到的差异表达的circ RNAs按照circ RNA特异性引物设计的方法和原理,设计跨环化位点引物,利用实时荧光定量技术对差异表达的circ RNAs进行表达水平的验证;miranda、Target Scan和KEGG Pathway等生信分析软件分析筛选出自噬相关的m RNAs,在此基础上筛选出与自噬相关的circ RNAs。(4)病毒感染细胞24h时收集细胞,通过实时荧光定量PCR检测自噬相关circ RNA RBM5以及mml-mi R-34c-5p、MDM4、P53和LC3B的表达水平,WB检测P53和LC3B蛋白的表达水平。构建circ RNA RBM5过表达环化载体,转染至Vero-E6细胞后检测circ RNA RBM5的过表达效率。转染后24h接种PEDV,通过实时荧光定量PCR和WB分别从m RNA水平和蛋白水平检测mml-mi R-34c-5p、MDM4、P53和LC3B的表达水平。检测PEDV-M、N、ORF3三个基因的表达量和测定PEDV TCID50来衡量病毒复制情况。结果:(1)PEDV能在Vero-E6细胞中稳定感染,以Vero细胞为对照组,Vero-E6细胞中PEDV-N基因的表达水平在24h、48h和72h极显著上升(***P<0.01);IPEC-J2细胞中的PEDV-N基因的表达水平在48h显著上升(**P<0.05),因此选用Vero-E6细胞作为PEDV体外复制机制研究的细胞模型。(2)Vero-E6细胞在被PEDV感染后48h细胞汇聚,细胞形态发生改变并皱缩在一起,细胞膜融合且形成大量合胞体,成功建立了PEDV体外感染Vero-E6细胞导致细胞病变模型;q RT-PCR结果显示在PEDV体外感染Vero-E6细胞后12-24h病毒N、M、ORF3基因的表达量变化倍数最大,因此后续试验时间均选择24h;成功绘制差异circ RNA ce RNA网络图。(3)选择成环碱基数较小且较为稳定的10个circ RNAs,利用q RT-PCR检测它们在PEDV感染Vero-E6细胞后的表达量的变化,q RT-PCR结果显示与转录组测序结果相同。通过生物信息学手段筛选出自噬相关的m RNA为MDM4,在此基础上得到与自噬相关的circ RNA为circ RNA RBM5。(4)PEDV感染Vero-E6细胞后,circ RNA RBM5的表达水平极显著下降(***P<0.01)。转染circ RNA RBM5过表达环化载体后,circ RNA RBM5的表达水平极显著上升(***P<0.01)。过表达circ RNA RBM5后,mml-mi R-34c-5p的表达水平显著下降(**P<0.05),MDM4的表达水平显著上升(**P<0.05),P53和LC3B的表达水平显著下降(**P<0.05)。WB结果显示,在过表达circ RNA RBM5后,P53和LC3B蛋白的表达量明显下降,细胞自噬被抑制,circ RNA RBM5-mml-mi R-34c-5p-MDM4-P53-LC3B调控Vero-E6细胞自噬。TCID50和q RT-PCR结果显示抑制细胞自噬会阻碍PEDV在Vero-E6细胞中的复制。结论:(1)获得PEDV感染前后差异表达的circ RNAs共58个,与自噬相关的circ RNA为circ RNA RBM5。(2)证实circ RNARBM5靶向互作的mi RNA为mml-mi R-34c-5p,mml-mi R-34c-5p的下游靶基因为MDM4,MDM4的表达水平的升高抑制自噬相关蛋白P53和LC3B的表达水平。(3)过表达circ RNA RBM5可以抑制细胞自噬,抑制细胞自噬会进一步阻碍PEDV在Vero-E6细胞中的复制。