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数量性状基因座(QTL)的检测和准确定位是影响遗传评定准确性的重要因素,从而也是制定育种方案时应用标记辅助选择(MAS)方法的前提,是大幅度加大畜禽选择遗传进展的关键。因此,这方面的研究已经成为分子数量遗传学十分引人注目的研究课题。影响QTL定位效果的因素很多,包括群体类型、规模、涉及的QTL数目、遗传标记的密度、性状遗传力等等,特别是分析中使用的遗传和统计模型对QTL检测和定位有较大的影响。在定位前,根据实际情况选择合适的定位方法有重要的意义。
阈性状作为特殊的遗传性状,大多具有较重要的经济价值。由于其遗传基础与普通的数量性状相同,因此把它归于数量性状的研究领域。本文采用最大似然区间定位法对阈性状的标记QTL进行连锁分析,并对影响阈性状QTL检测效率的主要因素(性状遗传力、QTL的方差贡献率、标记间重组率、阈值)进行了模拟研究。实验设计的群体为利用标记座位和QTL座位上都为杂合子的公畜与来自随机平衡群体的母畜群交配产生的半同胞个体组成,模拟产生的资源群体大小为500头。研究结果表明:当性状的遗传力较高,QTL方差贡献较大时,检验统计量LR值较大,检验效果较好;遗传力较低,QTL方差贡献较小时,LR值较小,QTL检测效果较差。另外,标记间重组率和阈值对QTL定位的准确度也有直接的影响,随着标记间重组率的增大,QTL定位的效果越差,当阈值在0.2-5之间时,QTL检测效果最好。