基于数据挖掘邓悦教授对阵发性房颤和频发房性早搏用药规律及其核心处方网络药理学作用机制研究

被引量 : 0次 | 上传用户:ggg_0907
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:通过数据挖掘法归纳总结邓悦教授治疗频发房性早搏和阵发性房颤的用药规律、用药特点、临床经验,提取核心处方。通过网络药理学初步探索核心处方治疗频发房性早搏和阵发性房颤的潜在作用机制,以期为中医药防治频发房性早搏和阵发性房颤的研究方向提供参考,为中药新药的发现和分子机制研究提供思路。方法:1.数据挖掘法收集2016年10月至2021年10月间就诊于长春中医药大学附属医院心内科邓悦教授门诊的频发房性早搏和阵发性房颤患者的电子病历信息,借助古今医案云平台V2.3.8的分布统计、复杂网络分析方法,应用IBM SPSS Modeler 18.0中的关联规则,IBM SPSS Statistics 26.0的聚类分析,挖掘并总结邓悦教授治疗频发房性早搏和阵发性房颤的用药规律、用药特点、临床经验,并提取核心处方。2.网络药理学与分子对接通过网络药理学对基于复杂网络分析出来的核心处方进行研究。(1)在中药系统药理数据库、Herb本草组鉴数据库及BATMAN-TCM数据库中对核心处方中丹参,苦参,远志,蝉蜕,甘松,降香,僵蚕,茯苓,酸枣仁,龙骨,牡蛎等11味中药活性成分进行筛选,将条件设定为化合物类药性(DL)≥0.18、口服生物利用度(OB)≥30%,通过其他数据库获得的活性成分则经过Swiss ADME数据库进行筛选,以胃肠吸收度为“high”,类药性符合以上两项及以上为条件标准的成分予纳入,同时通过检索万方、维普、CNKI及Pubmed等文献数据库进行补充,将筛选出来的活性成分通过TCMSP数据库和SWISS Target prediction搜索其相关靶点信息,筛选去重后通过Uniprot数据库筛选出人类靶点并规范基因名称;(2)分别从Gene Cards和OMIM数据库收集疾病相关靶点,建立疾病相关靶点数据库;(3)运用Venny2.1对核心方的预测靶点与疾病相关靶点进行映射交集并绘制韦恩图,两者交集靶点即为核心处方治疗疾病的潜在作用靶点。将核心处方的活性成分和筛选出潜在作用靶点导入Cytoscape 3.9.1软件中,以单味药、药物活性成分、作用靶点作为节点,节点之间的相互关系作为边,建立核心处方治疗疾病的“药物-成分-靶点”可视化网络图。同时将潜在作用靶点导入STRING数据库中构建蛋白互作网络。利用Cytoscape3.9.1软件中的网络拓扑分析,Betweenness Centrality(介数中间度)、Closeness Centrality(紧密度)、Degree(节点度)筛选核心靶点。(4)将得到核心处方治疗频发房性早搏和阵发性房颤的潜在作用靶点导入DAVID数据库中进行KEGG通路富集分析和Go生物学功能注释并可视化展示。(5)将基于网络药理学分析选取重要核心成分以及关键靶点,通过Auto Dock Vina进行分子对接模拟,并利用Pymol软件进行可视化。结果:1.邓悦教授治疗频发房性早搏和阵发性房颤的数据挖掘结果此次研究中收集500份符合纳入标准的电子病案,患者500例。其中女性患者252例,男性患者248例,年龄分布以60-69岁为主。在中医证型的统计中,主要为阴虚火旺证和心脾两虚证。在中药统计中共涉及178种中药,邓悦教授治疗频发房性早搏和阵发性房颤以温性、平性和寒性的药物使用最多,五味则以甘味、辛味、苦味药物为主,归经主要涉及肝经、心经、脾经。在中药的功效统计中,结果发现应用药物的功效主要有理气止痛、祛风止痛、清热凉血、祛痰、清热燥湿、平肝潜阳、生津、宁心安神、镇惊安神。基于Apriori算法关联规则中得到两项关联药物组合为12个,三项关联的药物组合为11个,主要涉及的药物为甘松、远志、蝉蜕、牡蛎、僵蚕、苦参、酸枣仁、龙骨。应用聚类分析发现邓悦教授治疗频发房性早搏和阵发性房颤中药处方主要聚为7类,分别为牡蛎、龙骨、远志、酸枣仁、茯苓、草果;蝉蜕、苦参、白附子、僵蚕、玄参、丹参;甘松;降香;党参;川芎、黄芪;延胡索、葛根、甘草。利用复杂网络分析得出邓悦教授治疗频发房性早搏和阵发性房颤的核心处方组成:丹参,苦参,远志,蝉蜕,甘松,降香,僵蚕,茯苓,酸枣仁,龙骨,牡蛎。2.核心处方治疗频发房性早搏和阵发性房颤的作用机制预测研究通过各数据库检索核心处方中11种中药成分,共筛选出988个基因,涉及144个活性成分。检索频发房性早搏和阵发性房颤疾病靶点进行筛选、整合去除重复后共获得疾病基因1298个。通过蛋白互作网络与Cytoscapte的网络拓扑分析筛选出核心处方治疗频发房性早搏和阵发性房颤的10个核心靶点,分别为ALB、AKT1、TNF、GAPDH、IL6、SRC、TP53、VEGFA、MAPK3、IL1β。通过GO富集分析发现,其主要涉及的生物学过程包括:信号传导、DNA模板转录的正调控、药物反应、细胞增殖的正调控、蛋白磷酸化、凋亡过程的负调控、缺氧应答、对外源刺激的反应、基因表达的正向调控、G蛋白偶联受体信号通路等。KEGG富集分析结果表明,核心处方中的活性成分对PI3K-Akt信号通路、MAKP信号通路、AGE-RAGE信号通路具有调控作用。基于网络药理学筛选出5位主要活性成分丹酚酸B、啤酒甾醇、菜豆素、酸枣仁碱、苦参碱,与筛选出的核心靶点ALB、TNF、AKT1、IL6、GAPDH分别进行分子对接,其中啤酒甾醇、菜豆素、丹酚酸B与AKT1对接结果最佳。结论:通过数据挖掘对邓悦教授治疗频发房性早搏和阵发性房颤的核心处方挖掘,及对用药经验进行整理,总结邓悦教授治疗频发房性早搏和阵发性房颤时,认为阴血亏虚是频发房性早搏和阵发性房颤发病的核心中医病机,亦强调内风致悸与痰瘀致悸的发病机制,在治法上注重熄风止悸与养心安神。通过网络药理学探究核心处方治疗频发房性早搏和阵发性房颤的潜在作用机制,结果表明其通过多成分、多靶点、多通路协同发挥作用,推测核心处方中的药物可能作用于TNF、IL6、AKT1等靶点通过PI3K-AKT信号通路、AGE-RAGE信号通路及MAPK信号通路发挥作用。本次研究将大数据背景下的宏观层面对邓悦教授辨证治疗的用药规律,与分子机制的微观层面相结合,多角度多维度的分析中医治疗方法,为核心处方治疗疾病的分子潜在作用机制提供研究思路。
其他文献
期刊
【目的】了解管制产品的技术性能和深入解读美国出口管制政策,提出一个自动抽取《商业管制清单》技术指标的方法。【方法】将技术指标表示为指标对象、指标名称、指标关系和指标数值组成的四要素,结合各要素在《商业管制清单》中的表现形式,构建了一种自动化的技术指标抽取方法,该方法能够自动抽取指标并将指标组织成结构化的四要素形式。【结果】实验结果表明,所提技术指标抽取方法可以在无监督的情况下有效地抽取《商业管制清
期刊
<正>张志娣主任中医师,系第二批全国优秀中医临床人才,第六批全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师,浙江省名中医。张师从医40余载,临证思路开阔,博采众长,中医药治疗肿瘤疗效显著。本文通过聚类分析、关联分析等数据挖掘方法探索和研究张师治疗肺癌的遣方用药规律,为临床治疗提供参考。1资料与方法1.1处方来源:选取张师自2017年1月至2022年8月在杭州市中医院的322名肺癌患者门诊医案,其中男15
期刊
随着信息技术、互联网技术的不断发展,新媒体时代悄然到来。新媒体是基于互联网和数字技术发展而成的新的媒体形式,是传统媒体的延伸和拓展,推动了媒介环境和媒体格局的变化。新媒体语境下的新闻叙事,是通过数字技术、网络技术等手段,将新闻内容以文字、图片、视频等形式呈现给受众的一种叙事方式。与传统媒体相比,新媒体语境下的新闻叙事更具交互性和时效性。在此叙事模式下,受众不再是被动的接收者,而是可以参与到新闻叙事
期刊
土壤微生物是湿地生态系统中土壤-植物系统生源要素迁移转化的引擎。探究湿地生态系统地上植物群落、土壤理化性质和空间结构与土壤细菌间的相互关系是维护湿地生态系统健康和稳定的关键。本研究运用双向指示种分析法(TWINSPAN)对碧塔海湿地采集的35个样方中的植物群落进行分类,并采用高通量测序技术对样方的表层土壤细菌进行测序,分析植物群落、土壤理化性质和空间结构与细菌群落间的关系。结果表明:双向指示种分析
期刊
煤制乙二醇的产品质量通过用精馏分离优化措施后,乙二醇的产品质量基本都能够达到聚酯级乙二醇的需要,核心是在聚酯级的收率及乙二醇精馏装置的能耗之间进行平衡。在对乙二醇精馏从流程、热量耦合、高效设备等方面优化,在产品质量和节能降耗方面取得很好的效果。
期刊
在最近二十余年里,大中型集团企业都普遍地启动进行司库建设。企业司库建设在开展过程中,其内容日益丰富,形式不断多样化,管理模式也在不断创新发展,涌现出了企业现金池模式、支付/工厂模式、服务中心共享模式,以及企业财资管理中心模式等。集团的财务公司既是集团企业内部单位,也是非银行金融机构,具有独特的地位,在集团企业的司库建设进程中有着很重要的意义。由于财务公司的金融特点,促使企业的资金管理范围界限更加规
会议
报纸
<正>全南县近年来调整林业产业结构,发展以桂花、厚朴、黄柏、香樟等为主的木本芳香中药产业,新发展芳香花木产业2万亩,全县芳香花木产业基地达10万亩;新建芳香药用植物基地2000亩、半野生灵芝基地5000亩,全县以灵芝、厚朴、黄柏等为主的林下种养面积达6万多亩。经营芳香苗木的农民人均收入已突破7300元,高出全县农民人均纯收入32%以上。初步形成布局合理、特色鲜明、功能齐全、效益良好的特色立体经济林
期刊
期刊