UBF基因与SVH基因在肝细胞肝癌中的功能研究及对人胚胎肝脏和肝细胞肝癌的基因表达谱分析

来源 :中国科学院研究生院(上海生命科学研究院) | 被引量 : 0次 | 上传用户:ws1984003
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肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是一种发病率较高且预后较差的恶性肿瘤,而中国是 HCC 的高发区域。本实验室利用代表性差异显示(Representational difference analysis, RDA)技术,寻找在 HCC 组织中表达发生改变的基因,并对其中的一些基因进行了细胞功能学研究。另外,本实验室还利用自建的 cDNA array 技术平台,分析了 HCC 与胚胎肝脏的基因表达谱,比较肿瘤发生机制与器官发生机制的异同。本论文就是围绕这两个方面展开论述的。 论文的第一章首先简要地描述了利用RDA技术获得在HCC中上调的基因,然后对其中的一个已知基因—上游结合因子(Upstream binding factor, UBF),进行了功能学研究。结合其他的检测技术,UBF 基因被证明在大约 66% (19/29)的 HCC 组织中上调。当 UBF 基因在人的肺成纤维细胞中过量表达时,可加快细胞生长;而用反义寡聚核苷酸在人的肝癌细胞中抑制 UBF 基因的表达时,可降低细胞在软琼脂糖中的形成克隆的能力并最终导致细胞死亡。值得注意的是,UBF 基因的表达还可提高细胞对抗肿瘤药物顺铂的敏感性。这提示了 UBF 基因对细胞的生存是非常重要的,而且它有成为抗肿瘤药物的作用靶点和临床用药 i<WP=3>中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所博士学位论文 论文摘要选择标记物的潜力。论文的第二章是对由 RDA 技术获得的在 HCC 中上调的未知基因—SVH 基因的功能学研究。我们完成了该基因的克隆,还发现 SVH 基因存在选择性剪切,四种剪切产物分别被命名为 SVH-A, B, C 和 D。运用定量实时 PCR 技术,发现只有 SVH-B 在大约 60% (28/46)的 HCC 组织中上调,而其它的剪切产物在 HCC组织中的表达没有一致性改变。当 SVH-B 在人的肝细胞株 QSG-7701 细胞中过量表达时,细胞的生长加快并在裸鼠中的成瘤能力增加;相反,用反义寡聚核苷酸来特异性抑制 SVH-B 在人的肝癌细胞株 BEL-7404 细胞中的表达时,可诱导凋亡的产生。这提示了 SVH 基因的不同的剪切产物具有不同的生物学功能,而且SVH-B这一特别的剪切亚型可能在HCC产生的过程中扮演了重要的角色。论文的第三章是利用含 5612 个基因/clusters 的 cDNA array, 对人的造血期的胚胎肝脏,成年正常肝脏及 HCC 组织的基因表达谱进行了比较。阶层聚类分析显示,这些样品按各自的生理状况聚类为三种类型:胚胎,成年正常和肿瘤。进一步分析在 HCC 发生和肝脏正常发生这两个过程中表达量有改变的基因,发现在两个过程发生同向变化的基因多与蛋白质表达和代谢相关;而仅在其中的一个过程中发生变化的基因多参与了细胞的信号转导/增殖和 mRNA 的转录。这揭示了在 HCC 发生过程和造血期的胚胎肝脏发育过程中,存在着独特的转录激活机制。
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