乳腺癌是人类常见的肿瘤之一，也是女性的主要致死肿瘤。越来越多的工作发现我们需要研究乳腺癌的分子和临床治疗方法的异质性，以确定有效的治疗策略。乳腺肿瘤包括多种组织学和分子亚型，浸润性导管癌（invasive ductal breast carcinoma，IDC）和浸润性小叶癌（invasive lobular breast carcinoma，ILC）是乳腺肿瘤最常见的两种组织学亚型。两种肿瘤亚型有独特的临床特征，所以准确诊断以确定治疗方案显得尤为重要。ILC多见多中心、双侧病灶，倾向于出现骨转移、腹膜和女性生殖系统转移，而高等级的IDC出现肺转移、胸膜转移和中枢神经系统转移较多。尽管准确鉴定这两种肿瘤亚型很重要，但目前没有基于分子的常规分类标准区分这两种肿瘤。本研究旨在建立一个基于基因表达谱的IDC和ILC基因诊断模型，为探索靶向治疗选择和提高预测预后效果提供分子基础。　　本研究从6个队列中共收集1845例浸润性乳腺癌病例，分成发现和验证队列。本研究在发现队列和验证队列的表达谱中，使用缩小质心法和弹性网线性模型定义了46个基因组成的基因集组成的基因模型，以区分IDC和ILC。在发现队列和验证队列中验证模型的一致性时，结果显示两组队列中模型评分的分布与病理诊断有强烈的相关性（p值<0.0001，T检验），并且在所有队列中具有相似的分布。在验证队列中验证中，模型预测结果与病理诊断结果的一致性为92％。将病理诊断结果和模型预测结果与肿瘤等级比较时，病理诊断具有更大的关联性（t值为-5.29；95%CI：-7.26，-3.34vs.-3.39；95%CI：-5.36，-1.44，通过有序逻辑回归）。　　本研究建立了一个区分IDC和ILC的基因诊断模型，本模型可能会成为预测预后效果的标准化工具。基于分子特征的基因模型对于探索靶向治疗策略也可能大有用处，ILC对于新辅助化疗反应较差，可将模型应用于肿瘤细胞系以探索新的有效的化合物。