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马铃薯是世界上最重要的非禾本科粮食作物。马铃薯普通栽培种(Solanum tuberosum L.,2n=4x=48)是同源四倍体,基因组高度杂合,其四倍体遗传的特点和薯块无性繁殖的弊端阻碍了马铃薯的育种进程。不利等位基因容易隐藏在四倍体基因组当中,在每一代育种循环过程中积累。如果能够有效克服二倍体马铃薯普遍存在的自交不亲和与自交衰退现象,二倍体马铃薯就可以通过连续自交剔除有害基因得到优良自交系,进行杂种优势育种。二倍体实生种子有性繁殖代替四倍体块茎无性繁殖,不仅可以节约薯块储藏和运输成本,还能有效避免种薯退化携带病毒的弊端。二倍体马铃薯育种有望代替四倍体育种,开创马铃薯育种史上的绿色革命。因此,评价二倍体马铃薯种质的遗传多样性,挖掘和有效利用优良性状基因显得尤为重要。本研究采用SSR标记评价192份二倍体马铃薯栽培品种核DNA遗传多样性,采用细胞质DNA标记分析其细胞质遗传背景,追溯母系祖先。主要结果如下:1.为了筛选多态性的SSR标记,使用55对SSR引物扩增39份遗传关系相对较远的二倍体马铃薯材料。选取分布在12条染色体上的12个具有高多态性的SSR标记,评价192份二倍体马铃薯栽培品种的核DNA遗传多样性。2.12对引物的SSR分析显示出192份材料之间不同程度的遗传多样性:这12对SSR引物PCR扩增产物的大小范围为118～244 bp。每对SSR引物扩增出的等位位点数为6～18个,平均8.2个。每对SSR引物产生多态性位点的比率介于85.71%～100%之间,平均值是98.81%。利用12对SSR引物对192份二倍体马铃薯栽培品种进行扩增,共检测到98个等位位点,其中97个为多态性位点,多态性比率达98.98%。多态性信息量(PIC)为0.3900～0.8415,平均值是0.7477。3.使用非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类,显示出所有供试材料的遗传关系:12对SSR引物可以将192份材料中的186份区分开;这192份材料遗传距离介于0.00517～0.41821 cM,在遗传距离为0.20359 cM处,所有供试材料被分为11个组群,其中第一个组群包含160份(83.3%)材料,另外10个组群包括了 1到7份不等的材料。聚类结果表明,被聚在同一个组群的地方栽培品种大部分属于同一个种且起源于同一地区。大部分材料被聚在第一个组群,同一个种或同一来源地的栽培品种大部分被聚在一个组群或亚组中,表明这些材料的遗传多样性相对较低,在分子水平上的亲缘关系较近。4.运用cpDNA和mtDNA标记分析了 192份二倍体马铃薯栽培品种的细胞质遗传背景,结果表明,供试材料的cpDNA类型有五种:P(72.4%)、A(15.6%)、M(9.9%)、W(1.0%)和 T(0.52%),mtDNA 类型有两种:β(88.5%)和 γ(11.5%),细胞质类型有 9 种:P/β(64.6%)、P/γ(7.81%)、A/β(15.1%)、A/γ(0.52%)、M/β(7.81%)、M/γ(2.08%)、W/β(0.52%)、W/γ(0.52%)和 T/β(0.52%),显然,P/β型的细胞质DNA占主导,从细胞质水平说明了供试材料的遗传基础狭窄。