20世纪九十年代以来，在全球化程度日益加深、世界经济呈现区域化特征的大背景下，区域创新体系引起了国外内学者的广泛关注。在区域创新体系中，孵化器作为区域经济发展的助推器，为社会经济发展提供了新的动力和源泉。然而孵化器在发展的同时，客观上存在着制度不健全、资金匮乏、服务水平低、资源整合能力不足等问题。在对孵化层面进行深入探索的过程中，从商业模式角度出发能更好地对孵化器的运营模式和服务水平等方面做进一步的分析。本文研究的重点是，在区域创新体系下，构建孵化器商业模式的理论框架，分析其构成要素及要素之间的相互关系，通过理论指导实践促进区域经济和孵化器自身的可持续发展。　　文章在绪论部分明确了研究背景及意义、研究目的和研究方法、论文架构和技术路线图，建立了总体的轮廓。在理论综述方面，对区域创新体系理论、商业模式理论和孵化器的相关理论进行了阐释，总结了国内外的理论研究现状。　　在区域创新体系下对孵化器商业模式的研究是本文研究的重点问题。通过分析区域创新体系和孵化器的相互作用，建立区域创新体系下的孵化器运营模式。在对孵化器商业模式的内涵、特征及构成要素的分析的基础上，构建出区域创新体系下孵化器商业模式的基本理论框架。　　在实证研究部分，在现行孵化器绩效评估指标的基础上，构建了区域创新体系下的孵化器商业模式投入产出指标，运用DEA模型对我国京津冀地区的29家国家级企业孵化器进行绩效评估分析。分析结果表明，孵化器应对其投入产出指标进行相应调整，实现孵化器商业模式各个要素的相互匹配。