贯彻和落实科学发展观，迫切要求加强生态环境的经济核算研究。当前应同时加强生态环境经济核算理论研究和实践应用研究。应充分运用深层生态学思想、可持续发展理论、环境经济学理论等，在分析市场经济体制条件下生态环境再生产特点的基础上，构建生态环境经济核算理论体系。 生态环境因素纳入国民经济核算的基本方式包括纳入GDP核算、纳入国民财富核算、纳入国民资产负债核算和纳入投入产出核算。生态环境的经济核算方法主要包括实物量核算和价值量核算。实物量核算可设计自然资源实物量核算表和环境资源实物量核算表。价值量核算的基础是资源环境估价方法的选用问题，在此基础上可分别设计土地资源、森林资源、矿产资源、水资源和环境资源价值量核算账户。 对生态环境纳入国民经济核算体系的模式，主要是增设“自然资源净值”和“生态环境福利”两个指标，用以反映自然资源和生态环境的流量和调整国民经济循环账户中的相关项目。同时，利用扩展化的国民经济循环矩阵技术，我们建立了生态环境经济核算循环矩阵，它的建立给经济—环境关系分析、建模及计算机技术的运用提供了极大的方便，它是一种既见森林又见树木的重要经济—环境分析工具。 在案例研究中，我们以江苏省森林生态环境经济核算为例，估算了江苏省2002年森林资源与生态环境价值，建立了江苏省森林生态环境经济核算循环账户及相应的循环矩阵。至此为生态环境经济核算循环矩阵在区域环境经济核算中的应用提供了一个范例。结果显示，江苏省2002年森林资源与生态环境总价值为879.71亿元，林木价值与森林生态价值比约为1：5，江苏省2002年“森林自然资源净值”和“森林生态环境福利”两项指标值分别为0.97亿元和635.41亿元。