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目的:采用16S rDNA技术对健康猫与腹泻猫粪便菌群进行了比较分析研究,以期初步了解猫粪便菌群结构及腹泻时的菌群结构变化。方法:首先通过临床症状对猫进行大体检查,采取猫新鲜粪便中的不同区域于-80°C保存,通过实验室检查确诊为细菌性腹泻后,提取细菌总DNA并以其为模板,采用通用引物扩增细菌的16S rDNA V3区,然后进行高通量测序,在进行各个层次的物种分析后,最终发现引起猫细菌性腹泻主要的病原菌;并采取猫的新鲜血液进行相关实验室检查,总结出猫腹泻时实验室指标的相应变化。结果:猫粪便中的正常菌群为厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门、变形杆菌门;猫腹泻时的优势菌群有厚壁菌门、变形杆菌门;另外猫腹泻时血中性粒细胞数目轻微升高、红细胞压积轻微升高、尿素氮含量轻微升高、白蛋白水平轻微降低。结论:各样本腹泻时由于发病前食入物质不同,其菌群结构可能有所不同,大肠杆菌志贺菌是此次样本中引起猫细菌性腹泻的病原菌;猫腹泻时机体主要表现为脱水和蛋白丢失。本研究将为猫粪便菌群的分析奠定了一定的基础并为后续研究提供了数据支持。