水稻光滑叶基因精细定位和品种间SSR多态性分析

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光滑叶是光身稻的一个重要形态标记,目前尚无关于光滑叶基因(gl-l)精细定位和克隆的研究报道。本研究的目的是对水稻光滑叶进行遗传分析和基因精细定位。用具有光滑叶特性的Lemont和R2与具有毛叶特性的川香29B为亲本材料,构建了Lemont/川香29B和R2/川香29B两个组合的F<,2>群体。用这两个F<,2>群体进行光滑叶性状的遗传分析:以两个组合的F<,2>隐性群体用分离体分组混合法(BSA)和SSR分子标记对光滑叶基因进行精细定位;用AMRAY-1000B扫描电镜观察了R2与川香29B的叶片表面结构。结果表明:(1)两个F<,2>群体的毛叶:光滑叶均符合3:1比例,且F<,1>代均为毛叶表型,说明水稻光滑叶属于一对隐性基因控制的质量性状遗传。 (2)先是在Lemont/川香29B组合的F<,2>初级定位群体中筛选到第5染色体上两个SSR共分离标记RM6320和RM7029,两标记位于光滑叶基因同侧,分别与光滑叶基因相距7.8cM和5.9cM。在R2/川香29B组合的F<,2>群体中共筛选到第5染色体上12对SSR共分离标记,其中用于作图的标记为8个,并把光滑叶基因定位在RM1024和自行设计的SSR标记GL311之间,两标记相距1.4cM(约283.1kb),分别与光滑叶基因相距1.2cM和0.2cM。(3)构建了覆盖光滑叶基因的遗传图谱和物理图谱,在这两个标记间共锚定了4个DNA clone。本研究结果为进一步光滑叶基因精细定位和图位克隆奠定基础,并为光身性状的转育提供了可用的辅助选择标记。用均匀分布于水稻12条染色体上的830对SSR引物在垩白性状表现差异大的川香29B与92343两品种间共筛选到34对SSR多态性标记,这34对SSR标记主要分布在水稻第1、6、8、11染色体上,这为控制垩白性状的基因定位作好了前期准备。
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