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为了充分挖掘和利用地方品种香猪的基因资源。本研究首先以肉质较好贵州地方品种猪香猪和肉质较差的外来品种猪大白猪为试验材料,选取胎次相同、体重相近的90日龄纯种从江香猪和纯种大白猪阉割公猪6头,屠宰,采集背最长肌,提取背最长肌总RNA。进行转录组测序,并利用生物信息学分析技术获得香猪猪和大白猪背最长肌基因差异表达谱,实时荧光定量验证测序数据的可靠性,筛选出两个品种猪肉质关键功能差异表达基因Selw和Sbp1。进一步以猪骨骼肌卫星细胞为模型,研究不同浓度硒(0、0.02 ug/m L、0.1 ug/m L、0.5 ug/m L、2.5 ug/m L)对骨骼肌卫星细胞增殖和Sel W和SBP1基因表达的影响。主要研究结果如下:(1)利用高通量RNA测序(RNA-seq)技术获得香猪和大白猪Raw reads分别为45568778个和47475542个。经过数据过滤后,在大白猪中得到42834534个clean reads,香猪中得到41202134个clean reads。比对到参考基因序列中唯一位置的reads数目,大白猪有27635302个,香猪有26143070个,匹配率分别为64.52%和63.45%。比对到参考基因组上的reads分布区域主要分在Exon(外显子)、Intron(内含子)和Intergenic(基因间区)上。本试验中大白猪和香猪比对到Exon区域的reads含量均较高,都高达80%以上;而比对到Intron和Intergenic两个区域的reads含量偏低,均在20%以下。最后对RNA-seq进行整体质量评估,R~2为0.95。说明本次实验获得质量较高和可靠的原始数据。利用比对到参考基因序列中唯一位置的reads进行香猪和大白猪差异基因筛选,通过基因表达维恩图分析,香猪和大白猪背最长肌中都表达的基因13247个,大白猪中特异表达的510个,香猪中特异表达的992个。差异基因聚类分析,香猪和大白猪形成不同聚类差异基因表达。通过火山图推断整体差异基因分布,香猪和大白猪背最长肌中差异显著基因318个,基因表达量显著上调的有184个基因,显著下调的有134个基因。利用差异基因GO和KEGG富集分析,筛选出四条主要生化代谢途径和信号通路。一磷酸腺苷活化蛋白激酶信号通路(AMPK signaling pathway)、转录因子信号通路(Fox O signaling pathway)、丙酮酸代谢途径(Pyruvate metabolism)和脂肪酸代谢途径(Fatty Acid metabolim),差异基因分别由15、13、8和8个,共计筛选44个差异表达基因。选取香猪和大白猪差异显著表达基因14个,实时荧光定量验证测序数据,其结果与测序数据相一致。筛选出一个在大白猪背最长肌中高表达基因Sel W,和一个在香猪的背最长肌中高表达基因SBP1。两个基因均与硒有关,因此将其筛选出来用于下一步实验。(2)不同浓度硒对细胞增殖和肉质关键功能基因表达的影响。从整体来看,硒具有细胞毒性,添加浓度越低,细胞生长越好;当浓度过高(2.5ug/m L)时,细胞出现死亡现象。添加不同浓度的硒以后,Selw基因的表达随着细胞的增殖而表达量上调(P<0.05),以0.02%的浓度效果最好。而SBP1基因的表达在细胞增殖和分化中都有明显的上调(P<0.05),以0.1%的浓度效果最佳。此研究结果可为后续Selw、SBP1的基因功能研究提供良好的基础。