改革开放以来,随着我国市场经济的迅速发展和政府职能的不断转变,社会组织逐渐发展壮大,开始成为国家建立创新社会治理机制的重要载体,在满足社会公共需求和推进社会建设方面发挥着重要作用。因此如何处理政府与社会组织的关系,成为当前政府在职能转变以及社会管理创新中所面临的重要课题。然而,在政府与社会组织合作互动中,经常存在局部利益冲突或竞争,政府对于社会组织的各项政策支持措施也存在差别和局限。如何改善政府与社会组织之间的合作模式,重塑政府与社会组织之间的互动关系,推动双方实现“共赢”局面,是本文探讨的重点。本文在研究了我国社会组织发展历程的基础上,对近十年来社会团体、民办非企业、基金会三类社会组织做了数据对比,充分研究了近年来社会组织发展趋势及结构变化,重点研究了各类社会组织扶持政策工具的适应性及其效果。同时,运用博弈的方法分析了政府与社会组织在静态和动态博弈中的合作竞争关系,研究影响政府与社会组织合作的主要因素及利益分配机制。然后,以深圳市盐田区的社会组织发展作为案例进行实证分析,最后对当前政府与社会组织存在的问题提出可操作性的建议。