本研究对宁夏区内5个规模化、有完整DHI数据的奶牛场进行数据收集，应用MTDFREML软件分析繁殖力遗传参数，并以94头荷斯坦奶牛为试验材料，应用PCR-SSCP技术研究Leptin基因和ESRα基因多态性与繁殖力的相关性，分析结果如下：　　 1.始配间隔性状的遗传力为0.2，1和2胎间隔性状的遗传力为0.01，2和3胎间隔性状的遗传力为0.03。始配间隔和1、2胎间隔的遗传相关为0.12，始配间隔和2、3胎间隔的遗传相关为0.65，1、2胎间隔和2、3胎间隔的遗传相关为-0.68。　　 2.在leptin基因外显子2区E2FB上，经分析存在影响奶牛繁殖的多态位点，测序首次发现位点102处T突变为C。在平均产犊间隔上，AA与AT差异极显著(P＜0.01)；AT与TT差异极显著(P＜0.01)；A为优势等位基因。　　 3.leptin基因外显子2区E2JW经测序并没有发现突变位点。　　 4.在leptin启动子区上，经分析存在影响奶牛繁殖的多态位点，测序首次发现位点616处A突变为G，617处T突变为C。在平均产犊间隔上，AB与AC、BB之间差异不显著(P＞0.05)，与BC和AA之间差异极显著(P＜0.01)。　　 5.在ESRα外显子1区上，经分析存在影响奶牛繁殖的多态位点，测序发现突变位点273处T突变为C。在平均产犊间隔上，CC和CD与DD之间差异显著(P≤01)。　　 6.leptin基因和ESR基因可以作为奶牛繁殖力的分子遗传标记；　　 本试验采用PCR-SSCP方法初次对leptin基因和ESR基因多态性进行研究，确定存在多个SNP位点，结合繁殖数据进行关联分析，证实这些SNP位点与繁殖力之间有很大的相关性。并首次发现儿个新的SNPs位点，这些SNPs对繁殖力有着不同程度的影响，可作为荷斯坦奶牛育种中繁殖力的分子辅助标记。