淀粉酶链霉菌CS1801几丁质酶的序列分析及克隆表达研究

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几丁质酶是一类可以催化由β-1,4糖苷键连接而成的几丁质并将其专一性降解为几丁寡糖、壳聚糖和N-乙酰葡萄糖胺的糖苷键水解酶。几丁质酶降解几丁质生成的产物几丁寡糖因具有良好的水溶性、抗氧化性和抗菌性能,广泛应用于化妆品、医药、食品和农业等领域。与传统的化学法降解几丁质相比,几丁质酶法生产几丁寡糖条件温和,对环境污染小,已成为几丁寡糖制备的发展方向。然而,野生菌产的几丁质酶催化效率低,仅有少数粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)、链霉菌(Streptomyces)和木霉(Trichoderma)等可以用于工业化生产,限制了其生产和应用。本研究以大肠杆菌BL21(DE3)作为表达宿主,以获得培养周期短、催化效率高的几丁质酶为目的,将来源于淀粉酶链霉菌CS1801(Streptomyces diastaticus CS1801)的几丁质酶 PROKKA01070 基因进行生物信息学分析,预测几丁质酶性质和结构,通过构建表达载体转化BL21(DE3)并诱导表达得到高活性重组几丁质酶,分析并确定几丁质酶结构中起催化作用的关键氨基酸残基。同时,探究几丁质酶的酶学性质,为几丁质酶工程菌应用于工业化生产提供理论基础。主要研究结果如下:(1)几丁质酶生物信息学分析。利用生物信息学数据库、软件分析几丁质酶的基因序列。通过理化性质分析,几丁质酶编码354个氨基酸,蛋白分子量为38 kDa,理论等电点pI为4.24,稳定性指标判定该酶为稳定性蛋白,亲水性平均值为-0.363,判定为亲水性蛋白;通过跨膜域和信号肽分析发现几丁质酶不行使跨膜功能,无信号肽存在;二级和三级结构预测表明几丁质酶二级结构由21.75%helix、67.23%loop和11.02%strand组成,三级结构由α-螺旋内桶和β-折叠外桶组成;几丁质酶催化域氨基酸序列比对发现,几丁质酶在催化结构域中存在典型的18家族保守区“DxxDxDxE”和“SxGG”结构,判断该几丁质酶属于18家族糖苷水解酶。(2)淀粉酶链霉菌CS1801几丁质酶的克隆表达。通过对几丁质酶PROKKA01070基因进行PCR扩增和TA克隆,获得大小约为1065 bp几丁质酶DNA片段和克隆载体ChiA/pMD19-T;通过构建表达载体和原核表达,获得重组质粒ChiA/pET-32a(+)和重组工程菌ChiA/pET-32a(+)/BL21(DE3);对重组工程菌ChiA/pET-32a(+)/BL21(DE3)诱导表达、SDS-PAGE分析和酶活性测定,获得大小为38 kDa可溶性几丁质酶,酶活为0.132 U·mL-1,比原始酶活(0.1U·mL-1)提高32%;将预测的几丁质酶催化域活性氨基酸进行定点突变,确定了几丁质酶催化活性的氨基酸残基位点为D128、D130和E132。(3)重组几丁质酶酶学性质的研究。重组几丁质酶的最佳反应温度为50℃,最佳反应pH为7.0;对重组几丁质酶热稳定性和pH稳定性研究发现重组几丁质酶在25℃和pH为5.0的缓冲液中最为稳定;金属离子和化学试剂对重组酶活性有影响,Zn2+、SDS在三种浓度下,对该酶均有强烈的抑制作用,Na+和Li+在任何浓度下对该酶均有促进作用,Fe3+、Mg2+和Ca2+在1 mM浓度下,对该重组酶有促进作用;重组几丁质酶底物特异性研究发现,重组几丁质酶对胶体几丁质分解能力最强为100%,对分解粉末几丁质、虾壳粉、蟹壳粉的能力很弱,分别为9.8%、6.5%、5.8%,不能分解壳聚糖和羧甲基纤维素钠;以胶体几丁质为底物时Km为0.281mg·mL-1,Vmax 为 0.536μM·mL-1·min-1,催化效率为 21.2 mL·s-1·mg-1。
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