植物寄生线虫对农业生产造成十分严重危害,据统计全世界因植物寄生线虫造成的主要农作物年损失率为12.3%,相当于每年损失1000亿美元左右的损失。目前利用食线虫真菌对植物寄生线虫生物防治已取得了一定成就。圆锥掘氏梅里霉(Drechmeria coniospora)是内寄生型食线虫真菌的模式菌株,同时也是研究线虫与真菌相互作用及线虫免疫反应的模式生物。圆锥掘氏梅里霉对线虫极具攻击性,能够高效的破坏土壤中线虫的种群数量,具有成为线虫生物防治制剂的潜力。但关于该菌与宿主线虫间互做的分子机制了解较少；参与其侵染线虫过程中的重要功能基因还不清楚；其杀虫功能基因和具有杀虫活性的代谢产物等毒力因子鲜有报道；以及其重要功能基因的表达调控研究还十分匮乏,需要进一步加强这方面的研究。首先,我们改良了专性内寄生型食线虫真菌圆锥掘氏梅里霉的实验室培养方法,并利用光学显微镜和扫描电子显微镜对圆锥掘氏梅里霉菌丝体以及分生孢子的形态结构进行了观察。同时对分生孢子对秀丽隐杆线虫的整个侵染过程生活史进行了详尽的记录。随后,对圆锥掘氏梅里霉的全基因组DNA序列进行了测定,并通过光学图谱技术对基因组深度测序数据进行了辅助拼接。获得了高质量的圆锥掘氏梅里霉全基因组完成图谱,对整个基因进行了详尽的功能注释。最后,通过与近缘真菌,植物寄生型真菌、昆虫成虫寄生型真菌、昆虫幼虫寄生型真菌和食线虫真菌比较基因组学分析,对圆锥掘氏梅里霉功能基因组进行了分析。并对其重要线虫侵染功能基因和次生代谢功能基因进行了鉴定。圆锥掘氏梅里霉功能基因组学研究为进一步鉴定该菌侵染过程中新型毒力因子、了解侵染过程、分析信号传导和基因表达调控等方面提供理论基础；为该菌的生态学功能进行系统性分析；同时也为生防真菌的遗传改良提供研究思路。