制药行业是一个以研发创新作为驱动力的行业。在中国制药行业快速规模化发展的过程中,研发创新已经成为其未来发展的大方向。在激烈的市场竞争环境下,研发创新能力的角逐已经不单纯是人力、资金投入多少的较量。研发资源的稀缺性要求企业必须把提高研发创新效率作为其保持创新性的首要问题。能否有效利用资源成为了提高制药企业研发创新水平的关键所在。本文以72家制药上市公司作为研究对象,运用DEA模型从静态和动态两个角度对其研发创新效率进行测度,研究结果显示我国大部分制药企业存在研发资源利用率低下的问题,且大部分制药企业的研发创新效率在2014-2017年期间呈现下降的趋势。然后,本文在借鉴前人研究成果并结合我国制药行业实际情况的基础上,建立我国制药上市公司研发创新效率Tobit模型来研究其研发创新效率影响因素,回归结果显示研发人员投入强度、企业经营规模和股权集中度对我国制药上市公司的研发创新效率有显著正效应;而研发费用投入强度和上市年限对研发创新效率有显著负效应;政府补助力度与研发创新效率之间没有显著相关性。据此,本文提出以下几点建议:(1)提升研发创新资源利用率,优化资源配置;(2)政府加强对补助资金使用的监管,提高政府补助的政策效果;(3)健全研发人才培养与引进机制;(4)持续完善企业研发创新管理制度,提高企业研发创新管理水平。