苹果小吉丁虫微卫星标记的开发及其遗传多样性

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiangwei521521
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新疆苹果野果林是我国宝贵的种质基因库,已被列为中国具有生物多样性国际意义的优先保护物种及国家II级濒危保护植物。苹果小吉丁虫Agrilus mali Matsumura入侵到新疆以后,造成新疆野果林大量的野苹果树枯死,使野苹果林面临着毁灭的威胁。该虫在新疆也严重危害栽培苹果,影响当地人民的经济收入。因此,开展苹果小吉丁虫相关研究工作迫在眉睫。本研究利用磁珠富集法开发了7对能够稳定扩增且多态性较好的微卫星引物,并结合线粒体COI标记和微卫星标记,分析了采自新疆野果林的7个苹果小吉丁虫种群和采自辽宁的1个苹果小吉丁虫种群的遗传多样性,研究结果对于进一步阐明苹果小吉丁虫入侵到新疆后的种群扩张与暴发机制,以及制定符合新疆野果林种群遗传结构特点的综合治理策略具有重要的指导意义。主要研究结果如下:1.本研究采用磁珠富集法开发苹果小吉丁虫的微卫星引物,构建了苹果小吉丁虫微卫星文库。经测序后共获得含有微卫星重复单元的克隆248个,阳性克隆率为82.6%。除探针使用的AC、AG重复外,还得到了CT、ATCA和TCGT的重复序列,重复次数主要集中在16~20左右。本研究得到的248个苹果小吉丁虫微卫星中,完美型131个,占52.8%;不完美型90个,占36.3%;混合型27个,占10.9%。根据结果设计引物并进行扩增,最终得到7对多态性较好且能够稳定扩增的引物。这7个微卫星位点在苹果小吉丁虫8个地理种群中共获得了102个等位基因,等位基因数在10~23之间、有效等位基因数在1.6738~12.2179之间、观测杂合度0.3125~0.9621之间、期望杂合度0.4041~0.9239之间、多态信息含量在0.3036~0.7961之间。2.利用以上开发的7个微卫星位点,对新疆和辽宁的苹果小吉丁虫种群进行分析。新疆7个苹果小吉丁虫地理种群间遗传距离为0.0714~0.5206,辽宁和新疆种群的遗传距离为0.4041~0.7876,辽宁和新疆苹果小吉丁虫的遗传距离差异较大。新疆苹果小吉丁虫种群的遗传相似度为0.5942~0.9311,而辽宁种群和新疆地区种群遗传相似度为0.4549~0.6676,明显低于新疆地区7个地理种群之间的遗传相似度。t检验结果显示,新疆种群之间的遗传距离显著低于新疆种群和辽宁种群之间的遗传距离(t=2.056,df=26,P=0.00014),新疆种群之间的遗传相似度显著高于新疆种群和辽宁种群之间的遗传相似度(t=2.056,df=26,P=0.00033)。新疆种群之间具有较为相似的遗传多样性,而新疆种群一辽宁种群之间差异较大。3.以线粒体COI基因作为分子标记,对8个地理种群的苹果小吉丁虫样本进行了遗传多样性研究。结果显示,共获得了19个变异位点和10个单倍型,其中单倍型Hap1为7个种群共享单倍型;苹果小吉丁虫种群在过去没有出现群体扩张和持续增长模式,群体大小保持相对稳定状态;新疆种群和辽宁种群的种群间分化明显。
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