纳米科学与技术是近年来的新兴领域,得到了世界各国的重视,迅速而广泛的发展起来。分子表面自组装是构筑二维纳米材料的简便常用方法。然而分子在表面上的自组装是一个复杂的过程,受到包括驱动力、溶剂、浓度、基底等多种因素的影响。表面自组装可以容易得到大范围的均一的纳米结构,但如何有效的定向的控制分子自组装的方向构筑目标功能材料是纳米科学领域的重点与难点。基于此,本论文主要以扫描隧道显微镜（STM）为研究工具,做了以下两方面的研究:以辛酸为溶剂,研究了正十八烷和硬脂酸（十八酸）在高定向热解石墨（HOPG）上的组装结构。我们发现,由于功能基团的不同,正十八烷和硬脂酸的组装结构也不同。正十八烷依靠分子与分子以及分子与石墨之间的范德华力构成“垄”状纳米结构,分子轴与“垄”呈90°排列。由于分子间的排斥力,“垄”与“垄”之间呈现一定间距。而硬脂酸由于羧酸基团之间形成0…H-O氢键而产生了“头对头”和“尾对尾”相互交叉的“垄”状结构。并且分子轴与“垄”之间的角度为（77.6±0.1）°。氢键相对于范德华力成为主要的驱动力。以“车轮”状聚钼酸盐{Mo₁₅₄}为研究对象,分别构筑了以乙醇、乙醇:1-苯基辛烷=1:1和乙醇:甲苯=1:1为溶剂的组装结构。研究发现,{Mo₁₅₄}在石墨上可以形成大范围的、均一的、多畴的、稳定的组装结构,并且结构不受溶剂的影响。{Mo₁₅₄}分子呈站立状,相互平行、倾斜形成“垄”状结构。在正偏压和负偏压下检测{Mo₁₅₄}分子在占据态和未占据态的信息,研究发现两种情况下STM图像呈现结构有微小差异。并且此组装结构可以在室温下保持一个月以上,这说明二维聚钼酸盐组装结构在实际应用中有很大潜力和可能。