核酸免标记检测新方法研究

来源 :中国科学院大学(中国科学院精密测量科学与技术创新研究院) | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangyiming1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
病毒广泛存在于自然界中,无时无刻都在威胁着人类的生命健康安全,对病毒进行快速、精准的检测对防止疾病传染和阻止疫情爆发具有重要意义。针对病毒的核酸检测是判断病毒存在的金标准,目前已有许多基于荧光方式(如实时荧光PCR)的检测平台被应用于病毒的高灵敏、高特异性检测。然而,现有荧光检测方法大多需要对报告分子进行额外的荧光基团标记,使其应用受到一定局限。基于免标记的荧光检测方法可以有效降低背景信号,且能简化试剂制备过程和降低成本,甚至可用于特殊场景下的原位检测,具有很强的应用价值。基于此,本论文基于G-三链体(G3)和G-四链体(G4)发展了两种核酸免标记检测新方法,并进一步结合微流控芯片技术建立了操作方便快速的核酸免标记检测平台,具体研究内容如下:1.本论文发展了一种基于G3和硫黄素T(ThT)的报告分子体系用于RNA靶标的免标记检测。虽然人端粒G4(ht-G4)已被广泛研究与使用,但研究ht-G3传感性能的报道甚少。首先,论文作者证明了 ht-G3可以显著增强ThT的荧光。其次,基于ht-G3序列设计了一种能形成发卡结构的DNA分子信标(ht-G3MB),它在没有靶标时可以限制ht-G3空间结构的形成;而当靶标存在时,发卡结构被打开,ht-G3空间结构形成,从而使ThT荧光显著增强,且增强幅度与靶标浓度变化成正比,灵敏度可达1 nM,并证明了该方法的特异性。最后,为进一步提升该方法的检测灵敏度,论文作者在系统中引入双特异性核酸酶(DSN)以剪切与靶标互补配对的DNA,使靶标RNA可以循环使用以达到扩大信号的目的,最后使灵敏度提高了 100倍,达到0.01 nM。该基于ht-G3/ThT的免标记检测策略有望广泛应用于RNA检测。2.本论文发展了一种基于ht-G4/ThT和CRISPR/Cas12a的DNA免标记检测新方法。论文作者所在课题组报道了 CRISPR/Cas12a可以反式剪切G4。基于此,本工作通过条件筛选确认了最佳的G4序列(ht-G4)和离子条件,当Cas12a被靶标激活时可以高效地对G4进行剪切,利用G4空间结构的破坏使ThT荧光大幅减弱消失,据此实现靶标的免标记检测。利用该Cas12a-G4/ThT方法,本论文进行了 HPV18质粒的检测,结果表明灵敏度可达0.1 nM;这一效果与荧光报告分子在同等检测体系下的灵敏度相同,具有重要的应用价值。3.本论文进一步提出了一种免光刻快速制备微流控芯片的方法,并将该方法制备的微芯片与上述Cas12a-G4/ThT检测方案联用实现了 HPV18的免标记检测。常规所使用的微流控芯片一般在超净间通过复杂的工艺(如光刻、显影等)制备出光刻胶阳模,再进一步获得PDMS芯片,其阳模加工时间长、成本高,不利于普及至普通的生化实验室使用。本论文使用激光切割机在透明胶带上烧蚀出微图案,并将胶带转移至硅片上,再将正光刻胶滴加至微图案处,抹平、加热即可在5min左右制备出阳模,进而快速获得PDMS芯片装置。由于切割胶带所需的能量很小,该方法制备的微通道分辨率可达100 μm。此外,通过改变胶带的类型和层数,可以很容易地控制阳模的高度。在充分证明该方法所制备的PDMS芯片件可与生化反应兼容后,作者进一步将其用于HPV18的免标记检测,结果表明该芯片可通过一步操作完成检测反应。本章节所发展的微流控芯片免光刻制备方法成本低、操作简单、时间短,且所制备的器件与各种常规生化实验兼容,有望广泛应用于一般生化实验室。综上所述,本论文研究了 ht-G3对ThT荧光增强的特性,并利用这一特性构建了 RNA靶标的免标记检测方法;进一步,结合ht-G4/ThT与CRISPR/Cas12a实现了 DNA靶标的免标记检测;最后,发展了一种免光刻制备微流控芯片的方法,并将其用于HPV18的快速检测。上述免标记的核酸检测方法,有望拓展到生活中病毒快速、低成本的检测。
其他文献
在国家公布《“健康中国2030”规划纲要》的背景下,健康传播以及青年健康更加成为值得关注的领域。本文致力于研究网络媒体中含有恐惧诉求的熬夜危害信息与大学生睡眠行为之间的关系并解决以下研究问题:1.大学生通过网络媒体接触到熬夜危害信息的程度;2.熬夜危害信息与大学生睡眠行为是否存在关联;3.熬夜危害信息如何影响大学生睡眠行为;4.如何有效提高网络媒体中熬夜危害信息的传播效果。通过问卷调查法进行实证研
学位
贫困问题是我国实现经济社会高质量发展、全面建成小康社会极大的阻碍。党的十八大以来,以习近平同志为核心的党中央将贫困治理摆在了治国理政的重要位置,我国的脱贫攻坚战取得了举世瞩目的成就。截止到2020年11月23日,我国832个国家级贫困县全部脱贫摘帽,区域性整体贫困已经得到解决,但这并不意味着贫困的真正消除和脱贫工作的彻底结束。与此同时,我国农村地区也出现了一些脱贫不稳定,已经返贫或有着极大返贫风险
学位
电力作为一种基础能源,跟社会活动的每个环节都息息相关,从发电到输电和配电,最后再到用电,输配电产品承担着电力能源传输的重要作用,输配电产品为整个社会再生产提供了具体设备和相关服务,电力建设是社会经济发展的主要指标之一,基础建设更是离不开电力能源的需求,因此输配电行业在近些年来迎来了蓬勃发展。Z电气公司专注于输配电行业110KV以下设备的研发、制造和销售,国内外销售业绩2020年已逾9亿元,面对高压
学位
伴随着我国科创板制度的落地,上市公司差异化表决权架构从原来的理论探讨终于落地到具体实践。从适用之初,差异化表决权就为大众所关注,并寄予了很高的期待。与其他国家相比,我国在该项制度的实践中尚缺乏经验,有诸多问题需要深入讨论与寻找解决之道。本文从结构上分为引言,正文与结语三大部分。其中正文主要分为四章,具体内容如下:第一章主要解决上市公司差异化表决权的基本理论问题。作为一种特殊的表决机制,差异化表决权
学位
作为两岸最重要的民间交往形式之一,两岸婚姻为推动两岸关系的和平发展作出了独特贡献。其中,两岸婚姻家庭子女有着天然的双文化成长背景,是连结大陆与台湾的特殊纽带,他们对两岸的认同是推动两岸进一步融合发展的重要课题。然而,由于深刻的历史与政治原因,两岸在经济、社会生活和意识形态等方面都存在显著差异,互相之间有着明确的“我群”与“他群”的区隔。那么,在这样的背景下,两岸婚姻家庭的父母是如何通过亲子沟通来塑
学位
锡矿属于世界各国所列出的关键矿产,其成因通常是与高分异、还原性、来自于上地壳变泥质沉积岩重熔形成的钛铁矿系列花岗质岩石有关。在复式岩体中往往出现在最晚阶段岩体的内外接触带。其成矿环境包括大陆碰撞环境、俯冲环境、后俯冲环境和大陆内部裂谷环境,局部可见弧后地区锡矿带与活动大陆边缘斑岩铜矿带平行分布(例如,南美、我国东南沿海和缅甸中东部)。近年来,随着锡石、黑钨矿和白钨矿等以及其它副矿物U-Pb测年技术
期刊
回顾20世纪二三十年代中国文化产业的发展我们可以发现,漫画业与电影业就像两个孪生兄弟,他们的成长期与黄金期高度吻合。事实上,历史中两者不但并肩同行,也曾携手合作。本文将从发生与历史、内容与主题、手法与修辞三个层面考察1921—1937年间漫画家群体与中国电影产业的跨界合作现象。
期刊
据《中国公众气候变化与气候传播认知状况调研报告》,当前我国公众对气候变化现象普遍有着较为清晰的认知和确认度,但积极行动的意愿往往较低。作为公众主要信息来源的新闻报道,还需探索更为有效的气候传播策略,以实现受众更积极主动的气候变化应对行为的产生。本研究聚焦气候传播的效果,围绕三大中心研究问题,就强调危害后果的恐惧诉求信息和强调行动能效的效能信息对行为意愿产生的影响以及具体的作用机制展开研究。根据文献
学位
伴随智能手机的普及和移动互联网的持续渗透,用户获取资讯的方式也随之转变。以今日头条为代表的移动资讯类APP已经成为用户获取信息的主要方式。毋庸置疑,在资讯领域,移动端在与PC端的战争中已经取胜,但是一方面目前移动端资讯市场竞争依旧激烈,头部资讯类APP之间差异不大,市场并不稳定,各家仍然需要铆足了劲争夺用户。另一方面,以微信为代表的内容生态和发展迅猛的短视频应用(以抖音和快手为代表)也在渗透资讯领
学位
词汇学习策略对于任何一门语言学习极为重要。本研究以贵州省独山县某中学的164名高二学生为研究对象,了解学生在外语学习中使用词汇学习策略的总体情况,探究学优生和后进生词汇学习策略的运用差异。结果表明:1.学生词汇学习策略总体使用频率不高;2.学优生和后进生在词汇学习的使用上存在显著性差异。
期刊