荒漠鼠类对植物群落、土壤特性有着显著影响。其采食活动显著影响着植被演替和被采食植物的丰富度。其掘洞影响着土壤的质地和结构、肥力、渗透性，这些环境因素的改变又影响着植被结构和物种组成。国外就荒漠鼠类扰动对土壤、植被的影响已经作了广泛、深入的研究，国内针对该领域的研究却少见报道。　　 大沙鼠广泛分布于新疆准噶尔盆地，为荒漠地典型鼠种之一，其对荒漠植物群落和土壤的扰动效应尚不清楚。研究其对荒漠土壤和植物的影响有助于深入理解鼠类在荒漠生态系统生态过程中的作用。2005年9月～2006年5月，作者3次赴古尔班通古特沙漠采集土样和植物样方数据。利用常规实验室方法对比分析了10组大沙鼠洞区和对照区表层(0～5cm)、深层(20～30cm)土壤含水量、养分、盐分等20项指标的差异性。调查了大沙鼠洞区、过渡区、对照区的植物种类、密度、盖度，并利用方差分析比较其差异性。结果如下：　　 1)大沙鼠的扰动，导致水分渗透能力发生变化。大沙鼠洞区表层土壤含水率低于无扰动对照区，深层高于对照区。　　 2)大沙鼠掘洞、排泄导致土壤养分含量变化。洞区表层土壤全N、全P含量增加，全K、速效N、速效P、速效K含量降低；洞区深层土壤全N、全P、全K、速效N含量减少，速效P、速效K含量增加。　　 3)大沙鼠的扰动促进了土壤微生物的发育，洞区土壤深层细菌、放线菌、真菌数量均高于对照区，其中真菌数量约为对照区的5倍。　　 4)大沙鼠采食、掘洞行为促进了草本植物，尤其是一年生草本植物的发育，抑制了小半灌木的生长。　　 5)大沙鼠的扰动改变了生物结皮的演替格局，导致生物结皮始终处于初级演替阶段。扰动程度的差异对生物结皮的种类、盖度产生不同的影响。