2009年起,中共中央国务院出台的《关于深化医疗卫生体制改革的意见》中明确,要建立和完善政府卫生投入机制,落实公立医院政府补助政策,完善政府对基本医疗保障的投入机制。上海市人民政府颁发的最新的《上海市深化医药卫生体制综合改革试点方案(2016-2020年)》也提到,建立合理的补偿机制,根据分类指导原则,对中医、传染病、精神病、职业病、妇产及儿科等专科医院给予投入倾斜。针对国家目前推行的医疗改革现状,为进一步深化公立医院体制改革,分类投入对于公立医院实现公益化来说非常重要。目前本市大多数公立医院补偿无法到位,且在财政补偿机制方面没有明确和规范的方式和标准,这就会造成公立医院投入的不合理性。本论文旨在深入研究公立医院补偿政策、财政投入及其落实情况,通过“公共物品理论”、“外部性理论”等作为理论基础,选取不同结构公立医院(中医、传染、精神、妇幼、儿科、综合等医院)经济运行等各类数据;访谈不同利益方(卫生行政管理部门、财政部门、医院管理者、医护人员及患者),分析补偿机制尤其是财政投入不合理、一刀切的原因与因素。文章通过对相关数据分析、反馈意见及调研,明确公立医院补偿应该补什么、补多少和怎么补;得出适宜的财政分类差异化、精准化补偿政策和投入机制,对深化医药卫生体制改革具有重要的现实意义,也关系到能否有效缓解老百姓“看病难、看病贵”等问题。