前言:肺癌是中国新发人数和死亡人数最多的恶性肿瘤,肺癌病理类型以肺腺癌为主。肺癌包括多种亚型,近年来肺腺癌的占比增加。尽管肺腺癌的化疗和分子靶向治疗取得了显著进展,但肺腺癌的生存率仍不令人满意。为了改善肺腺癌患者的预后,应该识别更多的肺腺癌靶向分子来诊断、治疗和判断患者的预后。生物信息学已经在医学研究中占据重要地位,并产生了很多科研成果。我们将生物信息学运用于发现新的肺腺癌靶向分子的研究中。增殖细胞核抗原结合因子（KIAA0101/PCLAF）调控细胞DNA的合成和细胞周期进程,肺腺癌中KIAA0101 m RNA水平是否与预后和肿瘤免疫浸润有关目前尚不清楚。Rho-GTPase激活蛋白30（ARHGAP30）可以增强GTP的内在水解并负调节Rho-GTPase。ARHGAP30的表达与肺腺癌之间的关系也尚不清楚。本研究拟用生物信息学方法分别对KIAA0101和ARHGAP30与肺腺癌之间的关系进行深入研究,为肺腺癌的发现新的靶向治疗分子和免疫治疗的研究奠定基础。本研究拟分KIAA0101和ARHGAP30两部分进行分析和阐述。第一部分KIAA0101与肺腺癌的表达、预后、肿瘤免疫、基因集富集分析和药物转录组学分析方法:使用Oncomine数据库、GEPIA数据库和Ualcan数据库中8对肺腺癌组织和正常肺组织的数据集,分析KIAA0101的差异表达分析。利用Prognostan数据库、GEPIA等数据库中6对不同KIAA0101表达水平的肺腺癌数据集,评估不同KIAA0101表达水平患者的预后。使用TISIDB数据库分析与KIAA0101相关的肿瘤免疫浸润。使用Linkedmics数据库对KIAA0101进行基因集富集分析。运用Drug Bank数据库对KIAA0101的药物转录组学进行分析。结果:KIAA0101在肺腺癌组织中m RNA的表达高于正常肺组织（8对数据集,具有统计学意义）。KIAA0101低表达的肺腺癌患者的预后优于高表达的肺腺癌患者（6对数据集,具有统计学意义）。我们发现了KIAA0101在肺腺癌中的基因调控网络。还发现了KIAA0101表达与不同肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）、免疫抑制剂、免疫刺激剂、MHC分子、趋化因子和趋化因子受体之间存在相关性,我们发现七种药物或化合物的代谢上调了KIAA0101的表达,还发现24种药物的代谢下调了KIAA0101的表达。结论:KIAA0101在肺腺癌组织中差异表达,KIAA0101高表达的肺腺癌患者预后较差。KIAA0101与细胞周期、核糖体、剪接作用和DNA复制有关。为肺腺癌的诊断、预后评估、免疫治疗和靶向治疗提供新的方向。第二部分ARHGAP30与肺腺癌的表达、预后、DNA甲基化、肿瘤免疫和基因集富集分析方法:运用Oncomine数据库、Surv Express数据库、GEPIA数据库、Ualcan数据库（6个数据集）分别进行ARHGAP30 m RNA和蛋白质的差异分析。运用Progno Scan等多个数据库中的12个数据集评估不同ARHGAP30表达水平患者的预后。运用Linked Omics数据库对ARHGAP30进行了基因集富集分析,包括对KEGG通路、Panther通路、Reactome通路、Wiki通路、基因本体论、激酶的分析目标网络、转录因子网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络进行了分析。运用TISIDB数据库进行ARHGAP30表达与肺腺癌组织中肿瘤浸润淋巴细胞、免疫刺激剂、主要组织相容性复合物分子、趋化因子和趋化因子受体的相关性分析。结果:ARHGAP30的DNA甲基化与ARHGAP30的表达呈负相关（6对数据集,具有统计学意义）。ARHGAP30 DNA甲基化较高的肺腺癌患者预后较差。ARHGAP30低表达的肺腺癌患者较ARHGAP30高表达的肺腺癌患者的预后差（12对数据集,具有统计学意义）。肺腺癌中ARHGAP30的表达与肿瘤浸润淋巴细胞的水平呈正相关,而ARHGAP30的甲基化与肿瘤浸润淋巴细胞的水平呈负相关。前五条通路是细胞周期、核糖体、蛋白酶体（附图4）、剪接体和DNA复制。基因组（细胞成分）的基因本体（GO）结果包括浓缩染色体、染色体区域、线粒体蛋白复合物、核糖体和纺锤体。基因组（生物过程）的基因本体（GO）结果包括染色体分离、DNA复制、细胞周期检查点、双链断裂修复和纺锤体组织。基因组（分子功能）的基因本体（GO）结果包括核糖体的结构组成、催化活性、DNA作用、单链DNA结合、解旋酶活性和催化活性以及作用于RNA。结论:ARHGAP30在肺腺癌组织中差异表达,ARHGAP30的DNA甲基化与肺腺癌患者预后不良相关,并通过抑制肿瘤浸润免疫的多种通路促进肺腺癌的形成和生长,为调控肺腺癌的基因治疗提供新思路。生物信息学研究在肺腺癌新的生物标志物的挖掘中有重要作用,可为高效率地肺腺癌研究拓展新方向。