中国南方部分牛属MHCⅡ类基因多态性研究

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该文测定了南方半野牛(独龙牛)、牦牛和黄牛三个牛属的MHCⅡ类基因DRA(外显子2、3)、LMP2(外显子4、5)、DRB3(外显子2)部分片段的序列.核苷酸序列分析表明DRA和LMP2在核苷酸和蛋白质水平均极为保守,而DRB3无论在核苷酸水平还是氨基酸水平均变化很大,虽然所测个体较少,但仍可看出其在独龙牛、牦牛和中国南方黄牛中的多态性极为丰富.DRB3核苷酸序列的异义突变均大于同义突变,表明其进化受正选择作用.四种核苷酸A、T、C、G在DRB3密码子第一、二、三位中的组成差异极大.DRB3平均及密码子第一、二、三位的转换/颠换比值(R)分别为:0.6、1.6、0.4、0.2,密码子不同位点间的转换/颠换比值(R)差异极为显著.独龙牛D2 DRB3氨基酸水平与其它序列差异较大,在54位缺失一个氨基酸,与现有序列比较,其单倍型为DRB3<*>0201.有趣的是独龙牛D2在保守的DRA的蛋白质水平与其它个体也不一样.
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