随着各种自然灾害发生的越来越频繁，世界各国人民以及政府和非政府组织开始越来越注重环境事项。我国也开始通过各种手段进行生态环境的保护与治理等，越来越多的环境保护专项资金投入其中，这些环境保护专项资金是否被用到合适的地方以及利用的效果如何等等，是社会公众共同关注的焦点之一，尤其是对于我国来说，公共资金的使用长期存在浪费严重的问题，致使社会公众对政府的职责和效能产生严重的质疑，由此迫切需要政府审计部门加强对这些专项资金的审计，提高政府公共行为的透明度，政府环保资金绩效审计应运而生。但是我国的环保资金绩效审计的起步较晚，虽然目前已经取得了部分成就，但是和西方发达国家相比仍然有较大的差距，需要我们对环保资金绩效审计的未来发展战略进行一定的研究，帮助政府审计部门能够更好地开展环保资金绩效审计。自从2011年7月审计署长刘家义提出了“国家审计与国家治理”理论之后，国内越来越多的学者开始更加关注国家治理与政府审计之间互为依存的关系。他指出国家治理是政治治理、经济治理和环境治理的综合体，而政府审计则通过依法监督政府权力的运用，提高政府运作效率、经济运行效率以及环境状况的改善等方面推动国家的有效治理，本文就是以国家治理作为研究的背景，希望通过本文的研究探索出环保资金绩效审计的发展战略与实施路径，为环保资金绩效审计的未来发展做出一定的贡献。