谷子农艺性状与Waxy基因全序列多态性位点分析

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fatcatgao
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以引进的31份夏谷子抗除草剂品系和自选品系为材料,对其农艺性状进行变异、聚类、相关和双关联分析。以3份糯质和2份非糯谷子品种为材料,利用Primer 5.0和DNA MAN软件,对其waxy基因全序列多态性位点、氨基酸序列及其二级结构域进行分析,主要结果如下:(1)供试品系质量性状遗传多样性指数在0-1.910之间,其中穗形、穗茎姿态较大,植株颜色、叶姿较小;数量性状变异系数变幅为8.11%-20.29%,其中穗粒重、产量较大,穗粗、茎秆粗度较小。(2)产量与穗茎姿态、穗形、单码籽粒数、穗码个数、千粒重、穗粒重、单穗重、穗粗、穗长、穗茎长度、倒二叶宽呈极显著正相关,与茎秆粗度呈极显著负相关。(3)在欧式距离4.0将参试谷子品系聚为六大类。第一类包括11份,均为夏谷子品系,产量为6000kg/hm2,茎秆较矮且粗;第二类只有2015137-2Ⅱ-4-1;第三类6份均为夏谷品系,茎秆较矮且粗;第四类包括2016025♀-2-4(大同29系选后代)等6份高产品系,株高适中,产量均在7935kg/hm2以上;第五类包括2015053 Ⅰ-2 Ⅰ-5-1(济谷13系选后代)等5份品系,产量为7335kg/hm2。第六类包括 2015(07)-4-10 和 2015137-2Ⅱ-5-1 等 2 份品系,产量为 7515kg/hm2。综合分析得出8份产量较高的品系,分别为2015(07)-4-10、2015(07)-4-11、2015053 Ⅰ-2 Ⅰ-4-2、2015053 Ⅰ-2Ⅱ-1-1、2015137-211-5-1、16C227-2-2、2016025♀-2-4和2016025♀-2-5。(4)waxy基因全序列总长度为4218bp。5份供试材料与参考基因序列比对共检测到54个突变位点,其中转换、颠换(易位)、插入和缺失突变依次分别为24个、19个、5个和6个。公谷68、红粘谷、赤谷4号、赤谷9号和杏黄粘与参考基因序列比对分别含有36、8、5、5和0个差异位点,其中公谷68存在5个插入,6个缺失,12个颠换和 13个转换,在Intron9(2883bp)和Intron6(2109bp-2125bp)存在 AGGTG 的插入和 ACATTCTTTCAGACTGC 的缺失。粳糯谷waxy基因序列比对中,公谷68、杏黄粘、红粘谷与非糯赤谷4号分别含有31、5、3个多态性位点。(5)粳糯谷之间检测到70个氨基酸序列差异位点,其中公谷68与其余4份材料存在69个差异位点,杏黄粘第248个氨基酸为S(丝氨酸),其余4份材料均为 N(天冬酰胺)。公谷 68 检测到 low complexity(51-67)、Pfam:Glyco transf5(81-341)、Pfam:Glycostransf1 (38(?)-524)、Pfam:Glycotrans14(396-533)和 low complexity(580-604)等 5 个 waxy 氨基酸序列二级结构域,红粘谷、杏黄粘、赤谷4号和赤谷9号均含有上述前四个结构域,但与公谷68结构域的氨基酸位置不同,其差异氨基酸数目依次分别为0、1、0、和12个。
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