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光是植物生长发育的一种重要调控因子,蓝光对海带(Saccharina japonica)的生长发育具有重要作用。本研究以高通量测序为手段,结合生物信息学分析以及qRT-PCR检测,研究了蓝光对海带microRNAs(miRNAs)表达谱的影响,获得了参与海带蓝光响应的miRNAs。以蓝光、黑暗处理海带幼孢子体为材料,构建了其小RNA文库,通过高通量测序,获得了差异表达谱。根据小RNA的分类注释及Mireap软件分析,得到20种海带新miRNAs。通过与长囊水云(Ectocarpus siliculosus)基因组的比对,预测了这20种新miRNAs的二级结构。其中,sj-MIR07,sj-MIR16,sj-MIR20均具有多种二级结构。通过预测这些新miRNAs的靶基因序列,证明其具有较强的保守性。这些基因主要与内切酶、钙调蛋白、半乳糖氧化酶、热休克蛋白及其调控因子等有关。其中,sj-MIR05、sj-MIR07、sj-MIR12、sj-MIR15在蓝光诱导下上调,推测其可能与海带蓝光诱导有关。通过对miRNA的差异表达分析,获得739种已知的miRNA和6种新miRNA与蓝光诱导相关。qRT-PCR表达分析表明海带幼孢子体中只有部分miRNA与高通量测序的结果相吻合,这可能与2种方法所采用的建库方法差异有关。通过GO(Gene ontology)富集分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)代谢网络分析,整合差异表达的数据,我们获得了一些miRNAs(如miR398、miR1110、miR2840),推测其可能参与了蓝光诱导响应,与受体信号、辐射反应、生物钟、光形态建成、光刺激响应、光周期及光转导相偶联,这些miRNA的功能有待在后续验证中深入探讨。