以PCR为基础的反向线点杂交(PCR/RLB)及16S-23S rDNA间区测序对奴卡氏菌分种、分型及临床研究

来源 :首都医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:marsmoonhoo
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:   探讨5个新出现的奴卡氏菌种16S-23S rDNA间区(ITS)DNA基因序列的多态性;筛查特异的奴卡氏菌种RLB探针;建立可以大量筛查奴卡氏菌种的PCR/RLB方法,以进行快速临床诊断及流行病学研究。   方法:   采用6例奴卡氏菌临床标本,即Nocardia beijingensis2例,Nocardiablacklockiae1例,Nocardia thailandica1例,Nocardia elegans1例及Nocaridavinacea1例及其他135例奴卡氏菌标本。对这6个标本首先进行ITS基因扩增、ITS区基因克隆、基因测序以设计奴卡氏菌种特异探针及种内ITS间区rDNA基因特异的探针,进行PCR为基础的RLB(PCR/RLB)杂交试验,不同的RLB型再进一步行ITS基因测序分析,以鉴别奴卡氏菌种及种内进一步分型。其他135例奴卡氏菌标本ITS基因扩增后直接做PCR/RLB试验,以筛查特异的奴卡氏菌种RLB探针。   结果:   结果发现2个N.beijingensis菌株ITS间区有8个基因序列型,4个RLB型,N.thailandfica有4个基因序列型,并存在4个对应的RLB型,N.blacklockiae有5个基因序列型,有3个RLB型,其中N-bla RLBⅢ型与所有N-blaITS探针杂交没有信号。N.elegans有5个基因序列型,3个RLB型,N.vinacea有5个基因序列型,2个RLB型。通过试验在种内识别了大量不同的ITS操纵子。对其他135例奴卡氏菌临床标本进行直接测序产生的是该基因序列所有型的组合。   结论:   在这5株新出现的奴卡氏菌中我们首次观察到ITS基因序列的多样性。通过把奴卡氏菌种及种内基因特异的探针结合在一张RLB膜上检测,对每一个奴卡氏菌种及每一个基因序列型都可以识别其独特的RLB型。这6个分离物的大多数克隆(102/108或94.4%)通过RLB试验可以准确认识,可以作为奴卡氏菌种进一步分型的潜在工具。这5株奴卡氏菌中以N.beijingensis-ITS,N.blacklockiae-ITS及N.elegans-ITS的探针具有高度特异性。RLB试验可以同时采用多个探针分析多个标本,在这5株奴卡氏菌菌种中证实RLB试验可以达到和ITS测序一样的敏感性。总之,我们首次通过克隆试验,准确的ITS基因测序认识了新出现的菌种,即N.beijingensis,N.blacklockiae,N.elegans,N.thailandica和N.vinacea。同时建立了可以大量筛查奴卡氏菌种的PCR/RLB方法,以进行快速临床诊断及流行病学研究。
其他文献
研究背景:   牛痘样水疱病(HV)样皮损常有三种表现模式:经典的HV、HV样淋巴细胞增生性疾病和HV样淋巴瘤。HV是一种少见的、慢性复发性、光敏性皮肤疾患,皮疹多位于暴露部位
文章通过对现有的异构整合技术进行分析比对,提出了基于元数据仓储构建区域科技文献共享服务平台,结合平台的建设实践,探讨了元数据仓储知识库的构建,并对平台的功能模块设计
生态观是指建立在生态科学所提供的基本概念、基本原理和基本规律的基础上,在人类-自然全球生态系统层次上进行哲学世界观的概括,能够用以指导人类认识和改造自然的基本思想
作为一国之君,李煜是失败的、无所作为的,他甚至想通过向宋纳贡得以保全基业。而作为词人,他却是天才,是“词中之帝”,开一代之词风。以957年宋灭南唐为界,李煜词分为前期和后期。
本刊讯(记者 卢剑锋)9月22日,PPTV网台联动——名家高峰论坛在北京召开,40余位业界专家、知名学者、制片人、导演、企业代表和媒体代表参加了此次会议。  2011年7月至9月,PPTV和湖南电视台共同打造的国内首档网台联动的真人秀节目“PPTV快女真人秀”成为今年暑期的热门娱乐事件,也为国内的电视台和新媒体提供了一个全新的合作样板。此次高峰论坛,正是以此为契机,对网台联动这种新模式进行深入地解
随着现代科学技术的飞速发展,生产方式发生了巨大的变化,大学生的学习时间在逐渐缩短,余暇时间在增多,充分利用余暇时间来满足自身的身体和精神需要,对当代大学生来说是极其
随着近年来教育改革的不断推进,我国高校的体育教学工作也取得了越来越多的成就。体育课程包含的内容有很多,羽毛球是其中的一大主要项目。然而由于学生多、课时少、学生基础差
目的:构建具有科学性、指导性及可推广性的重症监护病房护理质量评价标准,为护理管理者进行重症监护病房护理质量评价提供科学依据。   方法:2008年10月~2009年10月,在深入
随着社会政治、经济的不断发展,传统文化逐渐与之融合,衍生出了具有西方体育文化元素的现代体育文化。在具体的体育教育中,越来越多的文化因素渗进,它正朝着可持续的、科学的方向
目的:Bcl-2/腺病毒E1B19kDa相关蛋白3(BNIP3)作为一种线粒体促凋亡蛋白,在不同肿瘤及肿瘤发展的不同阶段,其表达和功能不尽相同,本课题组前期研究发现,BNIP3在食管鳞癌组织中