猪繁殖与呼吸综合征病毒2b蛋白互作宿主细胞蛋白的筛选

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2b蛋白由PRRSV的ORF2b所表达的结构蛋白,又称为GP2b蛋白,该结构蛋白对PRRSV感染宿主细胞起着重要作用,本研究通过酵母双杂交技术来筛选与PRRSV2b蛋白互作的PAM蛋白,主要研究内容包括三个方面。  第一步,构建文库菌株:以15日龄健康仔猪为原材料,分离培养猪肺泡巨噬细胞(PAM),从PAM中提取总RNA,以总RNA为模板合成cDNA。将扩增后的cDNA以同源重组的方式与线性载体pGADT7-Rec进行重组,并转化入Y187酵母感受态中,培养于SD/-Leu平板上。经培养后,随机挑取若干菌落进行PCR检测后并收获文库菌株,经文库滴度检测,文库的库容达6.69×107 cfu/mL。  第二步,钓饵菌株的构建:以PRRSV的CH-1R株为原始材料,提取基因组RNA,采用RT-PCR扩增2b基因。将2b基因扩增产物经双酶切后克隆至pGBKT7质粒上,构建出pGBKT7-2b重组钓饵载体。将钓饵载体转化入Y2H Gold酵母感受态中,培养于SD/-Trp平板上。经自激活检测和毒性检测,该钓饵菌株无自激活和毒性现象。提取酵母中的pGBKT7-2b重组载体,经酶切后电泳证实了钓饵菌株的构建成功。  第三步,互作蛋白的筛选及序列分析:将文库菌株与钓饵菌株进行杂交融合,并将杂交后的酵母培养物涂布于营养双缺失的DDO/X/A平板上进行培养,生长出的蓝色菌落转接至四缺培养基QDO/X/A平板上,并将依然为蓝色菌落进行菌落PCR检测,PCR检物进行测序,将测序后的碱基序列进行分析。将分析结果归类并命名为SX-1、SX-2、SX-3和SX-4等,该筛选结果经亲缘性比对后,分别得出与LGALS1、RPL12、LGALS3和RPS20等4种蛋白亲缘关系最近。其中,LGALS1出现机率最高。
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