小片段非编码RNA(small noncoding RNA,sRNA)是一类不编码蛋白的调控RNA分子,长度通常在50-500 nt之间。sRNA主要通过与目标靶基因的mRNA通过互补配对的方式结合,从而影响mRNA的稳定性和继续翻译的能力,从而调控基因的表达。耐辐射动球菌作为一个耐辐射抗性极高的革兰氏阳性菌株,针对其耐辐射抗性的研究可以让我们更加深入了解耐辐射动球菌的耐辐射机制,从而利用其耐辐射原理进行基因改造等应用。sRNA通常被认为和细菌在极端环境下的生理响应相关,主要在辐射、干旱、高温、高盐等极端条件下sRNA会发挥调控相关基因的表达或抑制,从而适应环境的变化。目前耐辐射动球菌的sRNA研究还是空白,因此本实验的首要目标是对耐辐射动球菌的全基因组进行sRNA预测,鉴定耐辐射动球菌潜在的sRNA。其次根据sRNA预测的结果对潜在耐辐射抗性相关的sRNA进行sRNA靶基因预测。本实验的另外一个重要目标是根据sRNA及其靶基因预测的实验流程,结合计算机编程技术,开发一套可视化的生物信息学预测软件的集成平台,为该菌后续研究提供流水化操作平台。本实验利用此预测平台,对耐辐射动球菌进行预测分析,获得疑似sRNA53条。耐辐射动球菌转录组测序分析结果获得疑似sRNA217条。通过sRNA靶基因预测分析,筛选获得2条疑似sRNA与差异表达基因存在调控可能性。