近年来，随着知识对于经济和社会发展的推动作用逐渐彰显，专利权制度也更加受到重视，专利权保护制度随之不断发展。在这其中，专利权行政保护制度由于其程序启动便捷，保护效率高而逐渐得到更为广泛的应用，发挥着对专利权的保护作用。尤其是在我国对外贸易的不断加深和建设创新型国家的社会背景之下，我国基于WTO规则和TRIPS协定等国际规则要求，对专利权的行政保护不断加深和发展，相关立法文件也逐步完善。但实践中还存在一些问题亟待进行深入的理论探讨和解决。本文在深入的考察我国的专利权行政保护制度特别是最近的立法文件和趋势的基础之上，选取美国为例，深入考察其专利权保护的相关制度特别是与专利权行政保护相关联和类似的若干具体制度，希望通过比较研究为完善我国的专利权行政保护制度提供有益的建议和参考。本文第一章简要介绍了专利权和专利权行政保护制度的产生及相关基础理论，包括专利权行政保护的概念、内容、特征，并对进行专利权行政保护的必要性和作用进行了明确。第二章对我国的专利权行政保护制度进行了深入考察，梳理了我国专利权行政保护制度的历史沿革过程，着重分析了我国现阶段新修订的若干立法文件中涉及专利权行政保护制度的内容，特别关注了假冒专利行为和专利执法相关规定的改变，并在此基础上指出了我国专利权行政保护中所存在的管理部门设置不合理、缺乏有效执法协调等问题。第三章对美国的专利权行政保护相关制度进行了研究，并与我国的专利权行政保护制度进行了对比。笔者首先从考察美国专利制度的产生和立法演变入手，明确了其相关法律渊源和专利权行政保护的机构设置。在此基础上对美国2011年通过的专利改革法案进行了深入的分析和研究，特别关注了其中的若干核心修正，如先申请主义的采纳、专利审查机制的变更和专利标识制度的修改等。随后试着将专利复审与宣告无效、虚假专利标识行为、专利权边境保护、专利侵权的救济等若干与我国专利权行政保护制度比较接近的制度进行了比较和分析。第四章在前文分析美国专利权保护相关制度的基础上，将关注点转回在我国专利权行政保护制度相关问题的解决的完善。笔者就这一问题从政策完善和具体行政保护的实现两大方面进行分析，又进一步细分为增加专利权行政管理服务和行政执法的完善两个方面。笔者认为要增强专利权行政管理部门的服务职能，同时从细化协调机制、加大执法力度、改进专利权海关保护等方面入手，加强专利权行政执法职能，保障专利权行政保护制度的落实，从而发挥专利权行政保护制度的作用。