亚洲柑橘木虱(Diaphorina citri Kuwayama),是至今为止众所周知传播黄龙病菌(严重威胁全球柑橘产量的病害之一)的自然虫媒之一,因此防控柑橘木虱有助于阻止黄龙病蔓延。这几年来,越来越多研究关注黄龙病菌的入侵如何引起寄主植物与宿主昆虫微生物组成的变化。然而,由于大多数昆虫和植物内生细菌群落的分离和培养困难,阻碍了相关的研究,随着Illumina测序的发展上述问题逐步得到解决。柑橘-黄龙病菌-木虱相互作用发生在一个复杂的微生物群落系统中。目前大多数研究集中在HLB菌与木虱肠道微生物的相互影响或HLB菌如何影响宿主柑橘内生微生物,但少之将这两者集中统一起来比较。因此本论文构建了柑橘-黄龙病菌-木虱肠道相互作用模型,利用Illumina Mi Seq测序研究分析HLB菌对木虱肠道细菌种群的影响和宿主柑橘不同组织(叶片、韧皮部)的细菌种群组成和数量变化。为以后筛选柑橘黄龙病生防菌进行生物防治提供理论基础。主要研究结果如下:1)韧皮部和叶片各组样品OTU数目分布在40-145之间,而根部样品OTU数目在500以上。每个组织健康组和患病组的OTU数目差别水平有限,而不同组织的OTU数量差异相对显著;2)实验室培养的木虱其肠道组样本OTU数目分布在38-62之间,柑橘野外木虱其肠道组样本OTU数目分布在60-71之间。表明实验室培养木虱其肠道组样本与柑橘野外木虱其肠道组样本OTU数量差异相对不显著。3)无论是Anosim组间差异分析还是MRPP组间差异分析可以看出柑橘四个不同组织样品组之间物种群落结构差异均达到极显著水平;不带HLB菌柑橘-带HLB菌柑橘的叶片、韧皮部各组间群落结构差异未达到显著水平;实验室培养的木虱其肠道与野外采集的木虱其肠道整体组间物种群落结构差异未达到显著水平。4)叶片患病组Y3丰度显著较高的为黄龙病菌属,鞘氨醇单胞菌属,羊膜杆菌属;在健康组Y1丰度显著较高的属有弧菌属、鲁杰氏菌属;韧皮部患病组R3丰度显著较高的为黄龙病菌属、膜杆菌属、红球状菌属、嗜酸菌属、粘液杆菌属。而弧菌属、分枝杆菌属、梭形杆菌属、类芽孢杆菌属在健康组R1丰富显著较高。5)韧皮部样品中与黄龙病菌属关系密切的菌属相对较多,而在叶片与黄龙病菌属密切相关或是负相关的菌相对较少。6)在柑橘野外木虱肠道样本中黄龙病菌属、念珠菌属、芽孢杆菌属、酸微菌属、大肠埃希菌属、寡养单胞菌属相对实验室培养的木虱肠道样本显著富集。