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基因间关系的研究一直是生物学研究的热点,而随着基因动态表达机制的发现,越来越多的人开始关注基因间的动态关系研究。而随着DNA测序技术地革新,DNA序列数据爆炸式地增长。伴随着DNA百科全书计划的启动,人们对DNA序列产生了全新的认识,科学研究者们不断地从非编码区的DNA序列中发现与基因调控相关的功能元件。而从DNA序列来挖掘基因间的动态关系的方法也日益受到人们的关注。本文基于传统的DNA比对算法和图像化表示方法,结合生物系统中普遍存在的分形特征,从DNA序列的分形语法规则入手,提出了对DNA序列进行图像化表示的方法和基因间动态关系的研究方法,主要研究内容如下：(1)基于传统DNA序列二维图像表示方法,提出了一种三维图像表示方法,不仅克服了原有二维图像表示方法交叉重叠的缺陷,同时通过示例中直观的展示了DNA序列图像与DNA序列功能潜在的联系；(2)通过生命系统中存在的分形和自组织现象模拟,对DNA序列存在分形特征和DNA序列中具有简单迭代规则进行了论证；(3)结合DNA序列的分形特征,提出了相应的DNA序列分形压缩方法和DNA序列图像化分形压缩方法,从而计算得到相关基因和序列的特征序列,并通过拟南芥生长发育过程中miRNA的动态表达情况,对基因间的动态表达的因果关系进行了研究,给出了相应的基因表达动态演化模型。