Ⅰ-Ⅱ期肺腺癌患者术后预后影响因素分析和免疫相关预后模型的建立

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenming000
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目的肺腺癌(Lung Adenocarcinoma,LUAD)发病率和死亡率高。由于肿瘤异质性,Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者在接受手术完全切除病灶后也存在复发和转移的风险,导致预后上的差异,所以有必要对Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的预后进行评估。本研究首先回顾性研究了2015年全年就诊于广西医科大学第一附属医院的93例接受手术治疗的Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的临床资料,分析总结出Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者术后的独立预后影响因素。其次,从癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载了Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的基因表达数据和临床资料,研究了EGFR、ALK、ROS1和BRAF突变状态与肿瘤微环境(Tumor Microenvironment,TME)的关系,并建立Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的免疫相关预后模型(Immune-related Prognostic Model,IPM)。方法1)回顾性研究了2015年全年就诊于广西医科大学第一附属医院的93例接受手术治疗的Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的临床资料,通过生存分析总结出Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的独立预后因素。2)从TCGA数据库中下载Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的基因表达数据和临床资料,用基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)、单因素Cox回归分析、基于LASSO(Least absolute shrinkage and selection operator)筛选的Cox比例风险回归分析找出与EGFR、ALK、ROS1和BRAF突变状态相关的具有核心作用的免疫相关基因;通过R软件中的“predict”函数计算每个患者的IPM风险评分,用根据受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic,ROC)曲线分析确定IPM风险评分的最佳阈值,将患者分为IPM-高危组和IPM-低危组;采用ROC曲线下面积(Area Under ROC,AUC)评价IPM的预测能力;通过基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的2个独立的Ⅰ-Ⅱ期LUAD队列的生存分析验证IPM的预后预测能力;利用CIBERSORT(Cell type Identification By Estimated Relative Subsets Of RNA Transcripts)估算TCGA数据库中的IPM-高危组和IPM-低危组样本的22种免疫细胞的比例,使用Mann-Whitney U检验比较IPM-高危组和IPM-低危组之间的免疫细胞比例和免疫检查点(包括CTLA-4、PDCD1、CD274、HAVCR2、LAG3和TIGIT)。结果1)截止2020年12月31日,93例患者中有48例(51.6%)患者仍存活。所有Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的1年、3年和5年OS分别为94.5%(95%CI:86.0%-97.9%)、76.2%(95%CI:64.5%-84.5%)和70.5%(95%CI:58.4%-79.7%)。其中病理分期为IA期的患者有45例,其5年OS为85.5%(95%CI:70.5%-93.2%)。2)单因素生存分析结果显示,T分期、N分期、病理分期、CEA、CA125、CYFRA21-1、Ki-67阳性率是Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者的预后影响因素。多因素分析显示CEA>3.06ng/ml、CA125>36.93U/ml、CYFRA21-1>2.91 ng/ml是Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者OS的独立预后不良因素。3)TCGA数据库中,共有171例患者具有可用的基因表达谱和突变数据,其中拥有生存信息的有164例。经分析,与EGFR突变、ALK易位、ROS1易位、BRAF突变相关的具有核心作用的免疫相关基因有3个,即磷酸二酯酶4B(PDE4B)、受体相互作用蛋白激酶2(RIPK2)和干扰素诱导跨膜蛋白1(IFITM1);在训练队列基于3个有核心作用的免疫相关基因建立IPM,IPM在训练队列、验证队列及TCGA全部Ⅰ-Ⅱ期LUAD队列中均有较强的预后预测能力;生存分析显示:IPM-高危组是Ⅰ-Ⅱ期LUAD患者OS的独立预后不良因素;IPM预后预测能力在GEO数据库的2个Ⅰ-Ⅱ期LUAD队列得到验证。4)IPM-高危组和IPM-低危组之间的免疫细胞比例和免疫检查点比较结果显示:IPM-高危组患者比IPM-低危组的患者有明显较高比例的M1型巨噬细胞(P=0.024)、活化肥大细胞(P=0.009)和较低比例的记忆B细胞(P=0.038)、CD4+记忆T细胞(P=0.001)和静息肥大细胞(P=0.001)。IPM-高危组患者的CTLA-4、PDCD1、HAVCR2和TIGIT的表达均显著低于IPM-低危组(CTLA-4:P=0.001;PDCD1:P=0.043;HAVCR2:P=0.030;TIGIT:P=0.021)。结论1)Ⅰ-Ⅱ期肺腺癌患者术后预后总体良好,5年总体生存率为70.5%,其中ⅠA期的患者5年总体生存率为85.5%。2)血清肿瘤标记物CEA、CA125、CYFRA21-1是Ⅰ-Ⅱ期肺腺癌患者术后的独立预后影响因素。3)本研究建立并验证了由3个免疫相关基因组成的一个免疫相关预后模型(IPM),该模型可独立预测Ⅰ-Ⅱ期肺腺癌患者的总生存率。4)IPM-高危组与IPM-低危组患者的免疫细胞比例和免疫检查位点具有差别。
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