小麦抗穗发芽位点QPHS.sicau.3D的STS标记开发及遗传分析

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小麦穗发芽(Pre-harvest sprouting,PHS)现象是世界性灾害,会严重影响小麦的产量和品质。穗发芽现象受多种因素的影响,比如籽粒休眠性、种皮颜色等。目前21条染色体均定位有穗发芽抗性QTL位点,效应较高的位点集中在3、4号同源群。本课题组前期从SHW-L1(人工合成小麦)的3D染色体鉴定的抗穗发芽位点QPHS.sicau.3D,在此基础上本研究在该位点(570.4-572.0Mb,参考中国春(CS)基因组v1.0)成功开发14对STS标记,并分析250份普通小麦的位点遗传差异与发芽率之间的关系。所分析的250份材料籽粒7天平均发芽率(GR)为73.32%,其中高抗穗发芽(GR:0-10%)占总材料数的6.80%,平均发芽率为3.64%;抗穗发芽(GR:10-30%)占总材料数的6.40%,平均发芽率为20.11%;中抗穗发芽(GR:30-60%)占总材料数的10.00%,平均发芽率为45.29%;穗发芽敏感材料(GR:60-100%)占总材料数的76.80%,平均发芽率为87.57%。根据标记鉴定的结果,将250份材料分为3种单倍型,其中Haplotype Ⅰ平均发芽率为40.88%,共48份;Haplotype Ⅱ平均发芽率为73.48%,共17份;Haplotype Ⅲ平均发芽率为81.72%,共185份。这些标记将为利用该抗性位点筛选抗穗发芽材料提供帮助,同时筛选出来的带有抗性位点的抗性材料可为育种工作者提供参考。
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