马国翰素有“清代辑佚第一人”的称号，着有《玉函山房辑佚书》576种661卷。这是马国翰最为突出的学术成就，也是研究马国翰之学者的研究重点。而他于辑佚之外，亦有大量诗文集和其他学术着作。只有全面研读马国翰的所有着作，才能对他的学术成就有更为全面的认识，这对于评价马国翰的学术贡献及评定他的学术地位是至关重要的。过去，学者能够见到的马国翰着作数量有限，所以拓展研究相对困难。《山东文献集成》的出版，改变了这一现状。其从第一辑至第四辑，集中影印出版了马国翰的各种着作及与其相关的着作20余种，大大丰富了研究马国翰所需的各种文献资料。所以，全面研究马国翰的各项条件已经成熟，故应当及时将马国翰研究向更广、更深处推进。　　前人研究马国翰，已经形成了较为丰富的成果，研究重点基本都在马国翰藏书和《玉函山房辑佚书》两个方面。关於马国翰藏书的研究，多涉及马国翰的藏书始末、《玉函山房藏书簿录》所录书籍的版本、种类及解题特色等方面。对《玉函山房辑佚书》的研究，多涉及《辑佚书》的作者问题、刊刻始末及马国翰的辑佚过程等方面。这些研究成果为后人研究马国翰提供了有益的参考和帮助，但是，研究对象相对集中也使得研究宽度稍显不足，故本文在研读马国翰著作的基础上，拟从六个方面入手，对马国翰进行较为全面的研究，在前人的基础上将对马国翰的研究进行拓宽。　　首先是马国翰行年考。论文在王重民先生所整理的马国翰年谱的基础上，从更多的原始资料入手，作了更为详细的马国翰行年录。其次是马国翰着作考。除列出马国翰着作目录外，更搜集到一些不见于马国翰诗文集中的诗文评语和书序。而从马国翰的著述来看，他的学术成就是多方面的，说明他是一位十分全面的学者。第三是马国翰交游考。论文梳理了马国翰不同时期所交往的友人。马国翰所交之人，多儒生、文人、学者，体现了中国古代士大夫的交友观，即注重精神交流和心灵共鸣。第四是马国翰藏书考。前人在马国翰藏书方面的研究较为充分，而本文注意到马国翰所藏清人著作尤多，从《玉函山房藏书簿录》所着录的清人著作，可窥清代学术、书籍出版及诗文创作等多方面的状况，所以，《玉函山房藏书簿录》的时代意义不容忽视。第五是《玉函山房辑佚书》研究。论文考述了清代辑佚学发展与兴盛的原因与《玉函山房辑佚书》的成书背景。对于马国翰窃章宗源成果的说法进行了辩诬，总结了马国翰的辑佚原则与辑佚方法，对《玉函山房辑佚书》引书进行了梳理，亦对《玉函山房辑佚书》之叙录进行了考察。《玉函山房辑佚书》各篇之叙录，形成一部庞大的佚书目录，与《玉函山房藏书簿录》一样，体现了马国翰的目录学成就。而同时着有存书、佚书两类目录的学者，除马国翰外别无二人，从这一点上来说，马国翰的目录学成就对于清代目录学的意义是非同凡响的。第六是马国翰文学研究。前人在对此涉及较少。论文通过详读马国翰著诗文集、笔记小说和诗文评着作，对马国翰的文学活动和文学成就进行了梳理和总结。　　马国翰一生勤勉，专精辑佚学，同时，他也是一位藏书家、目录学家和诗人，其在诸多领域皆有建树，是一位学术身份多元的文献大家。