企业孵化器是上世纪50年代诞生于美国的一种新的社会经济组织形式,我国在上世纪八十年代建立了第一个企业孵化器,20年来企业孵化器为我国的经济发展做出了突出的贡献,主要体现在对于高科技企业的扶持与资助上,为我国高新技术企业的发展提供了很好的前期的生存环境。针对企业孵化器评估的研究已经比较多,但是针对企业孵化器的在孵企业的孵化绩效的研究还不是很充分。本文根据企业孵化器整体的情况,按照投入产出的角度来分析哪些企业孵化器的投入产出是合适的,哪些存在投入不足或者产出的不足,根据上海市15家国家级企业孵化器的数据来做了案例分析。除此之外,文章还从政府投资的角度,探讨不同支持力度各种在孵企业的孵化绩效如何,建立了评价这些不同分类的企业孵化绩效的评估指标体系,并且同样以上海市15家国家级的企业孵化器的在孵企业数据作为案例分析,并且分别从不同行业、不同经营性质、是否为高新技术企业等角度将企业分类后按照建立的评价指标体系做出了相关的评估,给出了哪些类型的企业的孵化效果好一些,从而企业孵化器在选择入孵企业的时候给予一定的参考。